在意外伤害事故中双方各承担50%责任，且医保已报销部分费用的情况下，根据《民法典》的赔偿规则如下：

1. 赔偿总额的确定
   根据《民法典》第1179条，赔偿范围包括医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。若造成残疾或死亡，还需赔偿辅助器具费、残疾赔偿金、丧葬费和死亡赔偿金。
   关键点：赔偿总额以实际损失为限，需扣除医保已报销部分（医保报销属于社会福利，不减轻侵权人责任，但受害人不得重复获赔）。

2. 责任比例的分配
   双方各承担50%责任，意味着赔偿总额需按比例分摊。例如：

   • 若总损失为20万元，医保报销5万元，则剩余15万元由双方各承担7.5万元。
     
   • 若一方已垫付全部费用（如15万元），可向另一方追偿其应承担的7.5万元。

3. 医保报销部分的处理

   • 法律原则：医保报销不影响侵权责任认定，侵权人仍需按责任比例赔偿。但受害人已通过医保报销的费用，不得再向侵权人主张（避免双重获益）。
     
   • 实务操作：在计算赔偿时，需从总损失中扣除医保报销部分，再按责任比例分配剩余金额。

4. 特殊情形补充

   • 过错相抵：若受害人对损害发生也有过错（如未尽安全义务），可减轻侵权人责任（《民法典》第1173条）。但本案中双方已明确各50%责任，故无需额外调整。
     
   • 第三方支付：若存在商业保险理赔，需区分医保与商保的性质。商保理赔可能影响侵权人赔偿范围（需看保险合同约定），但医保报销不影响。

建议行动步骤：

1. 整理所有医疗费用单据、医保报销凭证及收入损失证明；
   
2. 计算总损失金额，扣除医保报销部分后确定剩余赔偿额；
   
3. 按50%比例向对方主张赔偿，并保留书面沟通记录；
   
4. 若协商无果，可向法院起诉，提交损失证据及责任认定材料。
   

如有进一步细节（如是否涉及伤残、对方是否配合赔偿等），可随时补充说明，我会为您细化分析。