结论：乙方将公章交由甲方经办合同是否违法，不能一概而论，需根据具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 公章管理的法律规定：

   • 公章是公司、企业等组织的重要法律文件签署工具，具有法律效力。根据相关法律法规，公章的使用和管理应当遵循严格的规定，通常应由公司指定的人员保管和使用，以确保公章的安全和合法使用。
   • 若乙方未经合法程序或授权，擅自将公章交由甲方使用，可能违反了公章管理的内部规定或相关法律法规，尤其是如果这种行为导致了公司利益受损或产生了其他法律后果。

2. 合同经办与公章使用的合法性：

   • 在合同经办过程中，公章的使用是合同生效的关键环节。如果乙方作为合同的一方，将公章交由甲方使用以签署合同，这本身并不直接构成违法，但前提是这种行为必须得到乙方的合法授权，并且符合乙方的内部管理规定。
   • 如果乙方未经授权或违反内部规定将公章交由甲方使用，且甲方利用该公章进行了非法活动或损害了乙方利益，那么乙方可能需要承担相应的法律责任。

3. 可能的法律后果：

   • 如果乙方将公章交由甲方使用导致合同无效或产生纠纷，乙方可能需要承担因公章管理不善而引发的法律责任，包括但不限于赔偿损失、承担违约责任等。
   • 如果甲方的行为构成犯罪，如诈骗、伪造公司印章等，乙方还可能因共犯或帮助犯的身份而面临刑事责任。

4. 建议与措施：

   • 乙方应建立健全公章管理制度，明确公章的保管、使用和审批程序，确保公章的安全和合法使用。
   • 在合同经办过程中，乙方应谨慎选择合作方，并确保对方具有合法的身份和资质。如果需要将公章交由他人使用，应签订书面协议并明确双方的权利和义务。
   • 一旦发现公章被滥用或存在潜在风险，乙方应立即采取措施，如报警、挂失公章等，以减少损失和风险。

进一步思考：在实际操作中，公章的管理和使用往往涉及复杂的法律关系和利益纠葛。因此，乙方在将公章交由他人使用时，应充分考虑各种可能的风险和后果，并采取必要的预防措施。如果遇到相关法律问题或纠纷，建议及时向我咨询，以便获得更具体和专业的法律建议。