公司通过微信转账发放奖金并不直接构成违法，但需满足一定条件并注意潜在风险。以下从不同角度为你详细分析：

1. 合法性角度

• 工资支付规定：根据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，工资（包括奖金）应当以货币形式支付给劳动者本人，且支付方式需符合双方约定或行业惯例。微信转账作为一种电子支付方式，本质上属于货币支付的一种形式，因此不违反法律对支付方式的基本要求。
• 书面约定：关键在于公司是否与员工就奖金的支付方式（包括微信转账）进行了明确约定。如果双方在劳动合同或公司规章制度中明确规定了奖金可以通过微信转账支付，且员工对此表示同意，那么这种支付方式就是合法的。

2. 潜在风险与注意事项

• 证据留存：微信转账记录虽然可以作为支付凭证，但相比银行转账，其证据效力可能较弱。因为微信转账记录容易被篡改或删除，且难以直接证明转账的性质（如是否为奖金）。因此，建议公司在发放奖金时，同时通过书面形式（如邮件、短信或纸质通知）告知员工奖金的金额、发放时间及支付方式，并保留相关证据。
• 税务合规：公司通过微信转账发放奖金时，需确保税务合规。奖金属于员工的应税收入，公司应依法代扣代缴个人所得税。如果公司未履行代扣代缴义务，可能面临税务处罚。
• 员工权益保护：如果公司未与员工就奖金支付方式达成明确约定，或未经员工同意擅自改变支付方式，可能引发劳动争议。员工有权要求公司以更正式、更安全的方式支付奖金，如银行转账。

3. 建议与措施

• 完善公司制度：建议公司在劳动合同或规章制度中明确奖金的支付方式、时间及金额等关键条款，确保双方权益得到保障。
• 加强沟通与确认：在发放奖金前，公司应与员工进行充分沟通，确认支付方式及金额等细节，并保留相关沟通记录作为证据。
• 确保税务合规：公司应依法履行代扣代缴个人所得税的义务，避免税务风险。
• 考虑员工感受：虽然微信转账方便快捷，但部分员工可能更倾向于银行转账等更正式、更安全的支付方式。公司应尊重员工的合理诉求，提供多样化的支付选择。

总结来说，公司通过微信转账发放奖金本身并不违法，但需确保双方有明确约定、税务合规且保留好相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。