非法进入公司属于违法行为，需根据具体情节和后果采取相应的法律措施，包括但不限于行政处罚、民事赔偿或刑事责任追究。以下是具体分析：

1. 行政处罚层面
   若非法进入行为未造成严重后果（如未盗窃、破坏财物或威胁他人安全），通常属于违反《治安管理处罚法》的行为。根据该法第四十条，非法侵入他人住宅（此处可类推适用于公司场所）的，可处十日以上十五日以下拘留，并处五百元以上一千元以下罚款；情节较轻的，处五日以上十日以下拘留，并处二百元以上五百元以下罚款。
   建议：公司发现后应立即报警，由公安机关调查取证后依法处罚。

2. 民事赔偿层面
   若非法进入行为导致公司财物损坏、商业秘密泄露或经营中断等损失，公司可依据《民法典》第一千一百六十五条要求侵权人承担民事赔偿责任。赔偿范围包括直接损失（如财物修复费用）和间接损失（如停业期间的利润损失）。
   建议：公司应保留现场照片、监控录像、财物清单等证据，必要时通过诉讼主张权利。

3. 刑事责任层面
   若非法进入行为伴随其他严重情节（如携带凶器、多次侵入、为实施犯罪做准备等），可能构成《刑法》第二百四十五条的“非法侵入住宅罪”（类推适用）或第二百六十四条的“盗窃罪”（若以盗窃为目的）。此外，若侵入行为破坏了计算机信息系统（如篡改数据），还可能触犯第二百八十六条的“破坏计算机信息系统罪”。
   建议：公司应立即固定证据（如电子数据、指纹等），并配合公安机关刑事立案侦查。

补充说明：

• 若非法进入者为公司员工，可能同时违反《劳动合同法》第三十九条，公司可依法解除劳动合同且无需支付经济补偿。
  
• 若涉及商业秘密泄露，公司可依据《反不正当竞争法》第九条主张侵权责任。
  

行动建议：

1. 立即报警并保护现场；
   
2. 收集证据（监控、证人证言等）；
   
3. 评估损失并决定是否提起民事诉讼；
   
4. 若涉嫌犯罪，配合刑事侦查程序。
   

如有进一步细节（如侵入目的、是否造成损失等），可向我补充说明，我会为您分析具体法律风险。