工厂因政府原因被环保罚款，一般情况下不能直接起诉环保局，但存在例外情形。以下从不同角度为你详细分析：

常规情况：不能直接起诉环保局

1. 行政处罚的合法性审查
   环保局作出罚款决定属于行政处罚行为。根据《行政处罚法》和《行政诉讼法》，若环保局在处罚过程中依法履行了调查取证、告知权利、听取陈述申辩等程序，且处罚依据（如环保法律法规）明确、事实清楚，则该处罚行为具有合法性。此时，工厂若仅以“政府原因”为由主张处罚不当，通常难以直接推翻处罚决定，也不构成对环保局的起诉理由。

2. “政府原因”的界定
   若工厂所称“政府原因”指政府要求工厂生产（如保障民生、应急需求等），但环保局仍以环保不达标为由处罚，工厂需证明：

   • 政府要求与环保处罚之间存在直接因果关系；
     
   • 政府要求具有强制性，且工厂已按要求采取合理措施（如申请临时排污许可、报备生产计划等）。
     但即使满足上述条件，工厂通常需先通过行政复议或行政诉讼挑战处罚决定的合法性，而非直接起诉环保局“滥用职权”或“不作为”。

例外情形：可起诉环保局的情形

1. 程序违法
   若环保局在处罚过程中存在严重程序违法（如未告知处罚事实、理由及依据，未听取陈述申辩，或处罚决定未加盖公章等），工厂可依据《行政诉讼法》第70条，以“行政行为违反法定程序”为由起诉环保局，请求撤销处罚决定。

2. 超越职权或滥用职权
   若环保局的处罚决定超出其法定权限（如对非管辖范围内的工厂处罚），或处罚明显不当（如罚款金额与违法情节严重不符），工厂可起诉环保局“超越职权”或“滥用职权”，请求法院撤销或变更处罚。

3. 行政不作为
   若工厂已按政府要求生产，并提前向环保局申请临时排污许可或报备生产计划，但环保局未依法处理（如未在法定期限内答复），导致工厂被处罚，工厂可起诉环保局“行政不作为”，要求其承担相应责任。

建议行动步骤

1. 审查处罚决定书
   仔细核对处罚依据、事实认定、程序步骤是否合法，重点检查是否有证据支持“政府原因”与处罚的关联性。

2. 申请行政复议
   若认为处罚不当，可先向环保局的上级机关或本级政府申请行政复议，复议机关会重新审查处罚的合法性与合理性。

3. 提起行政诉讼
   若复议结果不满意，可在收到复议决定书之日起15日内，或直接在知道处罚决定之日起6个月内，向法院提起行政诉讼，请求撤销或变更处罚。

总结：工厂能否起诉环保局，关键在于处罚决定的合法性、程序正当性及环保局是否尽到合理审查义务。若“政府原因”能成为合法抗辩事由，需通过行政复议或诉讼程序主张，而非直接起诉环保局“违法”。如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合证据为你分析诉讼策略。