购房合同因不能过户解除超过三年，若向法院起诉，法院可能会因超过诉讼时效而驳回诉讼请求，但存在特殊情况时法院仍会受理并判决。具体分析如下：

1. 一般情况：超过诉讼时效，法院驳回诉求

   • 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
   • 在购房合同因不能过户而解除的情境中，若购房者自知道或应当知道不能过户之日起超过三年未向法院提起诉讼，且在此期间没有发生诉讼时效中断或中止的情形，那么当购房者再向法院起诉要求解除合同、返还购房款或赔偿损失时，法院可能会以超过诉讼时效为由驳回其诉讼请求。

2. 特殊情况：诉讼时效中断或中止，法院仍会受理

   • 诉讼时效中断：如果在三年诉讼时效期间内，购房者曾向对方主张过权利（如发送律师函、提起诉讼等），或者对方同意履行义务（如承诺退款、赔偿等），那么诉讼时效会从中断时起重新计算三年。在这种情况下，即使原诉讼时效期间已经超过三年，但由于发生了中断情形，购房者仍然可以向法院提起诉讼，且法院会受理并判决。
   • 诉讼时效中止：在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因不可抗力或者其他障碍不能行使请求权（如购房者因病住院、出国等无法联系对方或提起诉讼），诉讼时效会中止。从中止时效的原因消除之日起，诉讼时效期间继续计算。因此，如果购房者能证明在诉讼时效期间的最后六个月内存在中止情形，且从中止原因消除之日起未超过三年，那么其向法院提起诉讼时，法院仍会受理并判决。

3. 其他注意事项

   • 购房者在提起诉讼前，应仔细审查购房合同及相关证据，确认是否存在诉讼时效中断或中止的情形。
   • 如果购房者确实超过了诉讼时效期间，且没有发生中断或中止的情形，那么其可以考虑与对方协商解决纠纷，或者寻求其他非诉讼途径（如调解、仲裁等）来维护自己的权益。
   • 在任何情况下，购房者都应保留好相关证据（如购房合同、付款凭证、沟通记录等），以便在需要时向法院提供证明。