结论：燃气公司因用户拒绝入户检查而停气的行为是否合法，需根据具体情况判断。一般来说，若燃气公司能证明入户检查是出于安全必要，且已履行合理通知义务，用户无正当理由拒绝检查，燃气公司可能依法采取停气措施；反之，则可能构成违法。以下从不同角度详细分析：
一、燃气公司入户检查的法律依据与必要性
根据《城镇燃气管理条例》等相关规定，燃气经营者有权对用户燃气设施进行安全检查，这是为了保障公共安全，预防燃气事故的发生。入户检查是燃气公司履行安全保障义务的重要环节，能够及时发现并消除安全隐患，如燃气管道老化、泄漏等问题。
二、燃气公司停气的合法性条件
安全必要性：燃气公司必须证明入户检查是出于安全必要，即存在可能引发燃气事故的安全隐患，且该隐患只能通过入户检查才能发现并消除。
合理通知义务：燃气公司在采取停气措施前，应履行合理通知义务，告知用户检查的时间、目的及拒绝检查的后果。通知方式可以是书面通知、电话通知或短信通知等，确保用户能够收到并了解相关信息。
用户无正当理由拒绝：若用户无正当理由拒绝燃气公司的入户检查，且燃气公司已履行上述通知义务，那么燃气公司可能依法采取停气措施。这里的“无正当理由”通常指的是用户没有合理的、合法的理由来拒绝检查，如因个人原因无法配合检查时间等，但并非不可抗力或紧急情况。
三、用户拒绝检查的合法抗辩理由
检查时间不合理：若燃气公司提出的检查时间与用户的工作、生活安排冲突，且无法协商调整，用户有权拒绝在该时间接受检查。但用户应提出合理的替代时间或方案，以便燃气公司安排后续检查。
检查人员资质或程序问题：若用户对检查人员的资质或检查程序存在合理怀疑，如检查人员未出示工作证件、未按照规定程序进行检查等，用户有权拒绝检查，并要求燃气公司重新安排合格的检查人员或按照规定程序进行检查。
存在其他安全隐患的解决方式：若用户认为燃气公司提出的检查并非解决当前安全隐患的唯一方式，且能够提供其他合理的解决方案，如自行聘请专业机构进行检查并出具报告等，用户也有权拒绝燃气公司的入户检查。
四、法律后果与建议
若燃气公司停气行为合法：用户应配合燃气公司的入户检查，及时消除安全隐患，以恢复供气。若用户因拒绝检查而导致燃气事故发生，可能需承担相应的法律责任。
若燃气公司停气行为违法：用户有权向燃气公司提出异议，并要求恢复供气。若燃气公司拒绝恢复供气，用户可以向当地燃气管理部门投诉或寻求法律援助，维护自己的合法权益。
建议：作为用户，在面对燃气公司的入户检查要求时，应首先了解检查的目的和必要性，积极配合检查工作。若对检查时间、人员资质或程序等存在疑问或异议，应及时与燃气公司沟通协商，寻求合理的解决方案。若遇到燃气公司违法停气的情况，应及时向相关部门投诉或寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。