结论：不合格肥料放在店里没有销售，是否违法需分情况讨论，主要取决于该肥料是否属于法律禁止流通的产品以及是否违反了相关储存规定。
若肥料属于法律禁止流通的产品：
- 法律背景：根据相关法律法规，某些特定产品（如假冒伪劣产品、含有有害物质超标的产品等）是被明确禁止生产、销售和流通的。即使这些产品未被销售，仅存储在店内，也可能构成违法行为。
- 法律后果：若肥料属于此类禁止流通的产品，店主可能面临行政处罚，如罚款、没收产品等，甚至可能承担刑事责任，具体取决于违法行为的严重程度和造成的后果。
若肥料虽不合格但不属于禁止流通产品，但违反储存规定：
- 法律背景：对于某些虽不合格但不属于禁止流通的产品，法律可能规定了特定的储存条件或要求。若店主未按照这些规定储存肥料，可能构成违法行为。
- 法律后果：店主可能因违反储存规定而受到行政处罚，如警告、罚款等。同时，若因储存不当导致肥料变质、泄漏等造成他人损害的，店主还需承担相应的民事赔偿责任。
若肥料既不属于禁止流通产品，也未违反储存规定：
- 法律分析：在此情况下，仅将不合格肥料放在店里未销售，通常不构成违法行为。但店主仍需注意，若肥料存在安全隐患或可能对他人造成损害的，应及时采取措施消除隐患或进行妥善处理。
- 建议：尽管不违法，但店主应主动与供应商联系，要求退换货或进行其他处理，以避免潜在的法律风险和损失。
进一步思考与建议：
- 店主应定期检查店内商品，确保所有商品均符合相关法律法规和质量标准。
- 对于不合格产品，应及时采取措施进行处理，如退换货、销毁等，以避免潜在的法律风险和损失。
- 若对肥料的合法性或储存要求存在疑问，建议咨询相关监管部门或专业律师，以获取准确的法律意见和指导。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。