员工未离职，企业是可以进行注销的，但必须依法履行相关程序并妥善处理与员工的劳动关系，以确保员工权益得到保障，避免潜在的法律风险和经济损失。以下从多个角度为你详细分析：
一、公司注销的法定条件与程序
根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，公司注销需满足一系列法定条件，并完成相应的清算程序。这包括但不限于：
- 成立清算组：公司应在决定注销后成立清算组，负责清理公司财产、编制资产负债表和财产清单、处理与清算有关的公司未了结的业务等。
- 通知债权人并公告：清算组应在成立后10日内通知债权人，并在60日内在报纸上公告。债权人需在规定时间内向清算组申报债权。
- 清偿债务：在清算过程中，公司应优先清偿员工的工资、经济补偿金、社保公积金等劳动权益，以及其他债务。
- 申请注销登记：只有在所有债务得到妥善处理后，公司才能向登记机关申请注销登记。
二、劳动合同与债权债务关系
劳动合同是公司与员工之间建立的债权债务关系，涉及工资、经济补偿金、社保公积金等权益。在公司注销前，必须对这些权益进行清算和处理，以确保员工的合法权益不受损害。
三、员工未离职时公司注销的处理方式
协商解除劳动合同：
- 公司可以与员工协商，达成一致后解除劳动合同。
- 根据《劳动合同法》，用人单位提出并与劳动者协商一致解除劳动合同的，应支付经济补偿金。经济补偿金按工作年限计算，每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资。
依法终止劳动合同：
- 若公司因破产、吊销营业执照、责令关闭、撤销或提前解散等法定原因注销，劳动合同将自动终止。
- 在此情况下，公司仍需按法律规定支付经济补偿金。
未妥善处理的法律后果：
- 如果公司未依法履行清算程序，未妥善处理员工的劳动权益，员工的工资、社保、经济补偿金等可能无法得到保障。
- 公司股东、清算组成员等可能承担法律责任，包括赔偿责任。
- 劳动行政部门有权查处违法行为，责令改正并给予处罚。
四、建议与防范措施
- 依法履行清算程序：公司在注销前应严格按照法定程序进行清算，确保所有债务得到妥善处理。
- 妥善处理劳动关系：与公司员工协商，确保按照法律法规进行补偿和安置，避免法律纠纷和额外经济负担。
- 重视员工权益：将员工权益放在首位，确保注销过程中员工权益得到充分保障。
示例说明：假设某公司因经营不善决定注销，但仍有部分员工未离职。在此情况下，公司应首先成立清算组，通知所有债权人（包括员工）并公告。然后，与员工协商解除劳动合同或依法终止劳动合同，并支付相应的经济补偿金。最后，在所有债务得到妥善处理后，向登记机关申请注销登记。
总之，员工未离职时公司是可以注销的，但必须依法履行相关程序并妥善处理与员工的劳动关系。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。