结论前置：若公司因调休在辞职时扣工资，需分情况判断其合法性，若公司行为违法，劳动者可通过协商、投诉或仲裁等途径维权。以下为具体分析：

1. 调休与工资扣除的合法性判断

   • 合法情形：根据《工资支付暂行规定》，用人单位在劳动者提供正常劳动后，应按劳动合同约定支付工资。若公司安排调休是基于劳动者之前加班的事实，且调休期间已正常支付工资，辞职时不应再扣工资。例如，劳动者周末加班，公司安排在工作日调休，调休日已按正常工资标准支付，辞职时扣工资则不合法。
   • 违法情形：若公司以调休为由，在辞职时无故克扣工资，或调休期间未支付工资，辞职时又扣工资，则属于违法行为。比如，公司未支付调休日工资，辞职时以调休为由扣减当月工资，这违反了工资支付规定。

2. 劳动者维权途径

   • 协商解决：劳动者可先与公司协商，要求公司说明扣工资的具体原因，并提供相关依据。若公司无法提供合理理由，应要求公司补发工资。
   • 投诉举报：若协商无果，劳动者可向当地劳动保障监察机构投诉，提供劳动合同、工资条、调休记录等证据，要求劳动保障监察机构介入调查，并责令公司改正。
   • 申请仲裁：劳动者还可向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付被扣的工资及可能的经济补偿。仲裁裁决具有法律效力，公司必须履行。

3. 证据收集与保留

   • 劳动者在维权过程中，应注重收集和保留相关证据，如劳动合同、工资条、调休通知、考勤记录等，以证明公司扣工资的行为违法。
   • 若与公司协商或投诉过程中有书面记录或录音，也应妥善保存，作为后续维权的证据。

4. 注意事项

   • 劳动者在辞职前，应仔细阅读劳动合同中关于工资支付和调休的条款，了解自己的权益和义务。
   • 若公司扣工资的行为涉及多个劳动者，劳动者可联合起来共同维权，提高维权效率。