一般农田不可以擅自建厂房，除非经过法定程序变更土地用途并获得相关审批。具体分析如下：

1. 土地用途管制原则
   根据《中华人民共和国土地管理法》第四条，我国实行土地用途管制制度，将土地分为农用地、建设用地和未利用地。一般农田属于农用地范畴，其用途受法律严格限制，未经批准不得擅自改变用途用于非农业建设（如建厂房）。

2. 农用地转用审批程序
   若需在一般农田上建厂房，必须完成以下法定程序：

   • 土地规划调整：需将涉案农田纳入当地土地利用总体规划中的建设用地范围，并经省级人民政府或国务院批准；
     
   • 农用地转用审批：向县级以上人民政府自然资源主管部门提出申请，经审核后报有批准权的人民政府批准；
     
   • 建设用地审批：在完成农用地转用后，还需依法办理集体建设用地使用权出让或划拨手续，并缴纳相关税费。

3. 违法建设的法律后果
   若未履行上述程序擅自建厂房，可能面临以下法律风险：

   • 行政处罚：自然资源主管部门可责令限期拆除、恢复土地原状，并处以罚款（《土地管理法》第七十七条）；
     
   • 刑事责任：若占用基本农田五亩以上或基本农田以外的耕地十亩以上，可能构成非法占用农用地罪（《刑法》第三百四十二条）；
     
   • 民事赔偿：若因违法建设导致他人权益受损，需承担侵权赔偿责任。

4. 例外情形
   在极少数情况下，若符合以下条件，可能允许临时使用农田：

   • 因公共利益需要（如抢险救灾、疫情防控等）；
     
   • 临时用地期限不超过两年，且到期后需恢复土地原状；
     
   • 需依法办理临时用地审批手续。

建议：若您有在农田上建厂房的需求，应先向当地自然资源主管部门咨询土地规划用途，并依法办理农用地转用和建设用地审批手续。如有进一步疑问，可直接向我咨询土地管理、行政处罚或刑事辩护等相关法律问题。