结论：第三人代为进行部分还款后，借款人一般不能以诉讼时效经过进行抗辩，但具体还需结合还款行为是否构成对债务的重新确认等因素综合判断。

详细分析：

1. 诉讼时效的基本规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
   • 在民间借贷纠纷中，如果借款人未在约定的还款期限内还款，出借人应在诉讼时效期间内提起诉讼或采取其他合法方式主张权利，否则可能面临因诉讼时效经过而败诉的风险。

2. 第三人代为还款的法律效果：

   • 当第三人代为进行部分还款时，这一行为通常被视为对原债务的履行或部分履行。从法律效果上看，它可能构成对原债务的重新确认或部分履行，从而影响诉讼时效的计算。
   • 如果第三人代为还款的行为被出借人接受，并且借款人对此没有提出异议，那么这一行为可能被视为借款人对原债务的认可，从而中断诉讼时效的计算。在这种情况下，借款人不能简单地以诉讼时效经过为由进行抗辩。

3. 借款人抗辩的可行性分析：

   • 一般情况：在第三人代为还款后，如果借款人没有提出异议，并且出借人接受了这一还款行为，那么借款人通常不能以诉讼时效经过为由进行抗辩。因为第三人的还款行为已经构成了对原债务的履行或部分履行，从而影响了诉讼时效的计算。
   • 特殊情况：如果借款人能够证明第三人的还款行为并未得到其授权或认可，或者该还款行为并未实际履行到出借人手中，那么借款人可能仍然有权以诉讼时效经过为由进行抗辩。但这种情况需要借款人提供充分的证据来支持其主张。

4. 法律建议：

   • 对于出借人而言，在接受第三人代为还款时，应确保还款行为得到借款人的明确认可或授权，并保留好相关证据，以备不时之需。
   • 对于借款人而言，如果面临第三人代为还款的情况，应及时了解并确认还款行为的合法性和有效性，避免因此产生不必要的法律纠纷。如果确实存在争议或疑问，应及时咨询专业律师以获取法律帮助。

举例说明： 假设甲向乙借款10万元，约定还款期限为一年。到期后，甲未还款。两年后，丙作为甲的朋友代为向乙还款5万元，乙接受了这一还款行为。在此情况下，如果甲没有提出异议或证明丙的还款行为未经其授权或认可，那么甲通常不能以诉讼时效经过为由进行抗辩。因为丙的还款行为已经构成了对原债务的部分履行，从而影响了诉讼时效的计算。

进一步思考： 在实际操作中，第三人代为还款的情况可能涉及更复杂的法律关系和事实认定。因此，在处理此类纠纷时，应充分考虑各种因素，包括还款行为的合法性、有效性、借款人的态度以及相关证据等。如有需要，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。