房屋租赁合同在租户入住后才签订，该合同本身仍具有法律效力，但可能因签订时间滞后引发一些特殊性质的法律问题或风险。具体分析如下：
合同效力不受影响
根据《民法典》第七百零六条，租赁合同的成立以双方达成合意（即签字或盖章）为生效要件，而非以签订时间与入住时间的先后顺序判断。即使租户已实际入住，只要双方在后续签订的合同中明确约定了租赁期限、租金、违约责任等核心条款，且无其他无效情形（如欺诈、胁迫等），合同仍依法成立并生效。
可能引发的法律风险
- 事实租赁关系与合同条款冲突：若租户入住后未及时签订合同，双方可能已形成事实租赁关系（即通过实际履行行为推定租赁合意）。此时若后续签订的合同条款与事实履行情况不一致（例如合同约定租金低于实际支付金额），可能引发争议。法院可能结合实际履行情况（如租金支付记录、沟通记录等）综合判断合同真实意思表示。
- 权利义务不明确风险：未签订合同期间，双方权利义务可能缺乏书面约定，一旦发生纠纷（如房屋损坏赔偿、提前解约等），租户或房东可能因举证困难而承担不利后果。
- 优先承租权等特殊权利影响：部分地区规定，租户在租赁期满后享有优先承租权，但若未签订书面合同，可能因无法证明租赁期限而影响该权利行使。
实务建议
- 补签合同需明确起始时间：若合同签订时间晚于入住时间，建议在合同中注明“租赁期限自实际入住日（XX年XX月XX日）起算”，避免因期限约定模糊引发纠纷。
- 保留实际履行证据：无论是否签订合同，租户均应保留租金支付凭证、物业费缴纳记录、房屋交接单等证据，以证明实际租赁关系及双方履约情况。
- 及时签订书面合同：为降低风险，建议双方在租户入住前或入住时即签订书面合同，明确约定租赁期限、租金、维修责任等条款，避免后续争议。
总结：延迟签订合同不影响合同效力，但可能因事实履行与书面约定不一致增加纠纷风险。建议通过补签合同明确条款、保留履约证据等方式降低风险。如有具体纠纷或条款设计需求，可进一步向我咨询。