针对您提出的“部门规章罚款数额可以低于条例吗”这一问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：
首先，我们需要明确部门规章的定义与性质。部门规章是由国务院所属的各部、委员会根据法律和国务院的行政法规、决定、命令，在本部门的权限范围内制定的规范性文件。这些规章旨在调整本部门内部的行政管理关系，并作为行政管理的依据。
接下来，我们探讨部门规章设定行政处罚的法律依据。根据《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，部门规章在行政处罚方面的设定权是受到严格限制的。具体来说，有两种情况：
在法律、行政法规已对给予行政处罚的行为、种类和幅度作出规定的情况下，部门规章可以在此范围内作出具体规定，进行细化或补充。这意味着，如果条例（通常指行政法规或地方性法规）已经规定了罚款的数额或幅度，部门规章可以在这个范围内设定具体的罚款数额，这个数额可以低于条例规定的上限，但不得低于条例规定的下限（如果条例有明确下限的话），也不得超出条例规定的范围。
尚未制定法律、行政法规的情况下，对于违反行政管理秩序的行为，部门规章可以设定警告、通报批评或者一定数额罚款的行政处罚。但此时，罚款的限额需由国务院明确规定。在这种情况下，部门规章设定的罚款数额自然是在国务院规定的限额之内，而这个限额通常也会考虑到与相关条例的协调性和一致性。
进一步地，我们需要理解部门规章设定行政处罚的限制与原则。部门规章在设定行政处罚时，必须遵循合法性原则、从属性与受限性原则以及保障权益原则。这些原则确保了部门规章在设定罚款数额时，既不会超越法律、行政法规的规定，也不会过分侵犯公民、法人和其他组织的合法权益。
综上所述，部门规章在一定条件下是可以设定一定数额的罚款作为行政处罚的，并且这个数额可以低于条例规定的上限（在条例有明确规定的情况下）。但重要的是，部门规章设定的罚款数额必须严格遵守法律、行政法规的规定，并在其框架内进行。因此，部门规章罚款数额是可以低于条例规定的上限的，但必须确保不违反法律、行政法规的强制性规定。
希望这个解答能够清晰、详细、有深度地解答您的问题。如果您还有其他疑问或需要进一步的解释，请随时告诉我。