国企工程收现金做保证金是否合法，需分情况讨论：
从保证金收取的合法性角度：
- 在建设工程领域，保证金是常见的一种风险防控手段，用于确保承包商或供应商能够按照合同约定履行义务。国企作为发包方，有权要求承包商或供应商提供保证金，这是合法的。
- 然而，关键在于保证金的收取方式。法律并未明确禁止以现金形式收取保证金，但实际操作中，现金交易存在诸多风险，如难以追踪、易滋生腐败等。因此，从风险防控和合规管理的角度出发，国企通常更倾向于通过银行转账等电子支付方式收取保证金，以便留下清晰的交易记录。
从国企内部管理规定角度：
- 国企作为国有企业，其经营活动需严格遵守国家法律法规和内部管理规定。许多国企内部有明确规定，禁止或限制现金交易，特别是大额现金交易。这是为了加强资金管理、防范财务风险和腐败行为。
- 如果国企内部管理规定明确禁止以现金形式收取保证金，那么国企工程收现金做保证金就是违法的，因为这违反了国企的内部管理规定。
从税务和财务合规角度：
- 现金交易在税务和财务上往往难以准确记录和追溯，这可能导致税务违规和财务不透明。国企作为需要接受严格审计和监管的主体，其财务和税务合规性尤为重要。
- 如果国企工程收现金做保证金导致税务或财务违规，那么这种行为不仅可能面临法律处罚，还可能损害国企的声誉和信誉。
法律建议：
- 对于国企而言，应尽量避免以现金形式收取保证金，而是采用银行转账等电子支付方式，以确保交易的透明性和可追溯性。
- 如果确实需要收取现金保证金，国企应制定严格的内部管理规定，明确现金收取的流程、审批权限和监管措施，以防范风险。
- 国企还应加强与承包商或供应商的沟通，明确保证金收取的方式和要求，避免因沟通不畅而引发的纠纷和风险。
可能后果：
- 如果国企工程收现金做保证金违反了国家法律法规或内部管理规定，国企可能面临法律处罚、行政处罚或内部纪律处分。
- 这种行为还可能损害国企的声誉和信誉，影响其与承包商或供应商的合作关系。
总结：国企工程收现金做保证金的合法性取决于多种因素，包括保证金收取的合法性、国企内部管理规定以及税务和财务合规性等。因此，国企在收取保证金时，应综合考虑各种因素，确保行为的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。