在房屋租赁合同中，关于租金纠纷的管辖问题，确实是一个需要细致考虑的法律点。首先，我们要明确的是，虽然合同当事人在一般情况下有权根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，通过书面协议来选择管辖法院，但这种选择并不是无限制的，它必须严格遵守法律对级别管辖和专属管辖的特别规定。
针对房屋租赁合同的特殊性，由于房屋属于不动产，根据专属管辖的原则，因不动产纠纷提起的诉讼应当由不动产所在地的人民法院进行专属管辖。这一规定是强制性的，意味着在房屋租赁合同纠纷中，原则上应由房屋所在地的法院来审理，这是不能通过当事人的约定来改变的。
然而，这并不意味着在房屋租赁合同纠纷中，当事人就完全无法体现自己的意愿。在符合专属管辖的前提下，如果房屋所在地存在多个有管辖权的法院（比如不同级别的基层法院，或者同一级别的不同法院但因地域划分等有管辖权），当事人仍然可以通过书面协议在这些有管辖权的法院中选择一个具体的法院来进行管辖。但这样的约定必须满足一个前提，即它不得违反级别管辖的规定。换句话说，不能将一个本应由基层法院审理的案件，约定由中级或更高级别的法院来审理。
因此，在处理房屋租赁合同纠纷，特别是关于租金的纠纷时，当事人应当注意以下几点：
专属管辖优先：要牢记房屋租赁合同纠纷案件原则上由房屋所在地法院专属管辖，这是不可更改的法律规定。
约定管辖的条件：在满足专属管辖的前提下，如果确实存在多个有管辖权的法院，当事人可以通过书面协议选择一个具体的法院，但这个选择必须合法，不得违反级别管辖的规定。
明确约定：如果当事人想要约定管辖，那么约定管辖的内容必须在合同中明确写出，选择的法院应与房屋或合同纠纷有实际联系，且不能违背法律的强制性规定。
综上所述，房屋租赁合同纠纷案件的约定管辖并非完全自由，而是在专属管辖和级别管辖的双重约束下进行的有限选择。当事人在签订合同时，应充分了解并遵守这些法律规定，以确保约定的有效性，避免未来可能出现的管辖争议。