结论：已经抵押的土地，法院是可以查封的，并可依法进行拍卖。但拍卖所得价款应优先偿还抵押权人，剩余部分再分配给其他申请执行人。同时，土地一旦被查封，就不能再进行抵押。
详细分析：
查封与拍卖的法律依据：
- 根据《最高人民法院关于人民法院执行工作若干问题的规定（试行）》及《最高人民法院关于<民事诉讼法>的解释》的相关规定，人民法院对被执行人所有的、其他人享有抵押权的财产，可以采取查封、扣押措施，并可以进行拍卖。这意味着，即便土地已设定抵押，法院仍有权出于执行债务纠纷等目的对其进行查封和拍卖。
抵押权人的优先受偿权：
- 查封并不影响抵押权的效力，抵押权人的优先受偿权依然存在。当被查封的抵押土地被依法处置时，抵押权人就拍卖所得价款有优先于普通债权人受偿的权利。这是为了保护抵押权人的合法权益，确保其在债务纠纷中能够优先得到清偿。
查封后土地的抵押限制：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法被查封的财产不得抵押。因此，土地一旦被查封，就属于法律规定不得抵押的财产范围。被查封的土地，其处分权受到限制，不能满足作为抵押物的要求。即使土地使用权原本可以用来抵押贷款，但在被查封的状态下，这一权利被暂时剥夺。
- 试图将被查封的土地进行抵押，不仅违反了法律规定，而且可能导致抵押合同无效，给债权人带来风险。在债务人不能按时偿还债务时，债权人可能无法对抵押财产优先受偿。
实际操作及影响：
- 在司法实践中，法院有权对抵押的土地进行查封和拍卖，以执行相关债务纠纷。这既保障了抵押权人的合法权益，也为其他债权人提供了债务清偿的可能。
- 土地被查封后，其作为抵押物的资格被剥夺，这要求债权人在接受抵押时，需仔细审查抵押物的法律状态，以避免潜在的风险。例如，在接受土地作为抵押物时，债权人应查询该土地是否已被查封或存在其他法律纠纷，以确保自己的抵押权能够得到有效保障。
建议：
- 对于抵押权人而言，在设定抵押权时，应充分了解抵押物的法律状态，确保抵押物未被查封或存在其他法律纠纷。同时，在抵押期间，应密切关注抵押物的法律状态变化，以便及时采取措施保护自己的合法权益。
- 对于其他债权人而言，在申请执行债务纠纷时，如涉及抵押土地，应了解抵押权人的优先受偿权，并合理预期自己可能获得的清偿份额。
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