当税务稽查接到虚开发票线索时，会按照严格的法定程序和内部规范展开调查处理，具体流程及要点如下：
线索受理与初步核查
税务稽查部门收到线索后，首先会进行形式审查，确认线索来源是否合法（如举报、系统预警、其他部门移送等），并评估线索的可查性（如涉及金额、行业、主体是否明确）。若线索模糊或缺乏基本证据，可能要求补充材料或暂存待查；若线索清晰，会立即启动初步核查程序，通过调取企业税务登记信息、发票数据、纳税申报记录等，判断是否存在虚开嫌疑（如发票流向异常、进销项不匹配、税负率异常等）。
立案与深入调查
若初步核查发现虚开可能性较高，税务稽查会正式立案，并成立专项调查组。调查重点包括：
- 资金流核查：通过银行账户交易记录，追踪发票对应的资金是否真实回流（如个人账户转账、第三方支付平台等）；
- 货物流核查：要求企业提供货物运输单据、仓储记录、合同等，验证发票记载的货物是否实际存在或流转；
- 发票流核查：通过金税系统比对发票的开具、取得、抵扣链条，确认是否存在“票货分离”“环开”“对开”等异常模式；
- 询问相关人员：对企业法定代表人、财务人员、业务经办人等进行询问，制作询问笔录，固定证据。
法律依据：根据《税收征收管理法》第五十四条，税务机关有权检查纳税人的账簿、记账凭证、报表及有关资料，询问与纳税有关的问题和情况，责成纳税人提供与纳税有关的文件、证明材料和有关资料。
- 证据固定与性质认定
调查过程中，税务稽查会全面收集证据，包括书证（如合同、发票、银行流水）、物证（如货物）、视听资料（如监控录像）、电子数据（如金税系统数据）、证人证言等。证据需满足真实性、合法性、关联性要求，形成完整证据链后，才能认定虚开行为。
虚开行为的认定标准：
- 为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；
- 让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；
- 介绍他人开具与实际经营业务情况不符的发票。
注意：即使企业未实际取得虚开发票的非法利益（如未抵扣税款），只要存在虚开行为，仍可能被认定为违法。
- 处理与处罚
根据调查结果，税务稽查会区分不同情形处理：
- 情节轻微且主动改正：若企业能证明虚开行为系因疏忽或被欺骗，且未造成税款流失，可能仅要求补缴税款、滞纳金，不予行政处罚；
- 一般违法行为：根据《发票管理办法》第三十七条，虚开发票的，由税务机关没收违法所得；虚开金额在1万元以下的，可以并处5万元以下罚款；虚开金额超过1万元的，并处5万元以上50万元以下罚款；构成犯罪的，依法移送公安机关；
- 涉嫌犯罪：若虚开税款数额较大（如虚开增值税专用发票税款数额在1万元以上），或造成国家税款损失重大，税务机关会按照《行政执法机关移送涉嫌犯罪案件的规定》，将案件移送公安机关立案侦查，企业及相关责任人可能面临刑事处罚（如虚开增值税专用发票罪，最高可判处无期徒刑）。
企业应对建议：
- 收到税务稽查通知后，应立即配合调查，提供完整、真实的资料，避免隐瞒或伪造证据；
- 若对虚开事实有异议，可委托专业律师协助核查证据，提出抗辩理由（如善意取得虚开发票、被蒙骗等）；
- 主动补缴税款及滞纳金，争取从轻或减轻处罚；
- 若涉嫌犯罪，尽早委托律师介入，争取取保候审、缓刑等从宽处理。
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