结论：故意伤害别人致轻伤，即便已经私了赔了六万且过了三年，在特定情况下仍然有可能被起诉，但一般情况下，过了追诉时效则不再追诉。以下从不同角度为你详细分析：
从刑事追诉时效角度分析
- 追诉时效规定：
- 根据《中华人民共和国刑法》第八十七条规定，犯罪经过下列期限不再追诉：法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年；法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，经过十年；法定最高刑为十年以上有期徒刑的，经过十五年；法定最高刑为无期徒刑、死刑的，经过二十年。如果二十年以后认为必须追诉的，须报请最高人民检察院核准。
- 故意伤害致人轻伤，依据《中华人民共和国刑法》第二百三十四条规定，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制。所以其法定最高刑为三年以下有期徒刑，追诉时效为五年。
- 是否已过追诉时效：
- 从你描述的情况看，事情已经过去三年，尚未超过五年的追诉时效。不过，如果在追诉期限内又犯罪的，前罪追诉的期限从犯后罪之日起计算。也就是说，如果行为人在这三年内又犯了其他罪，那么故意伤害轻伤这一罪行的追诉时效就要从犯新罪之日起重新计算五年。
- 另外，在人民检察院、公安机关、国家安全机关立案侦查或者在人民法院受理案件以后，逃避侦查或者审判的，不受追诉期限的限制。如果当时案件已经立案或者受理，行为人逃避侦查或审判，那么无论过了多久都可以被追诉。
从私了协议效力角度分析
- 私了协议的合法性：
- 双方私了达成的赔偿协议，如果是双方真实意思表示，不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该协议是合法有效的。这意味着行为人已经履行了赔偿义务，在一定程度上可以视为对受害人的补偿。
- 私了协议对刑事追诉的影响：
- 私了协议并不能完全阻止刑事追诉。刑事责任和民事责任是两种不同的法律责任，私了解决的是民事赔偿问题，而刑事追诉是国家对犯罪行为的制裁。即使双方达成了私了协议，司法机关仍然可以根据案件情况决定是否追究行为人的刑事责任。不过，私了协议以及行为人的赔偿情况可能会在刑事诉讼中被作为量刑情节考虑，例如可能会对行为人从轻处罚。
从受害人的权利角度分析
- 受害人报案权：
- 受害人有权向公安机关报案，要求追究行为人的刑事责任。只要在追诉时效内，公安机关应当依法立案侦查。如果受害人之前已经报案，公安机关已经立案，那么即使过了三年，案件仍然会继续处理。
- 受害人谅解的影响：
- 如果行为人已经积极赔偿并取得了受害人的谅解，受害人可以出具谅解书。在刑事诉讼中，谅解书是一个重要的量刑情节，法院可能会根据谅解情况对行为人从宽处理，甚至有可能适用缓刑等。
建议：如果你就是涉及此事的行为人，建议你主动向公安机关说明情况，积极配合调查；如果是受害人一方，若认为有必要追究行为人的刑事责任，且在追诉时效内，可以向公安机关报案。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会结合具体情况为你详细解答。