公司赔偿并非仅按照底薪进行，而是根据劳动者在本单位的工作年限及劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资来确定。以下是对此问题的详细解析：
一、赔偿工资的计算基础
月工资标准：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，赔偿工资的计算基础是劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
- 这个平均工资是税前工资，且包括了计时工资、计件工资、奖金、津贴、补贴等所有应得货币性收入。
特殊情况处理：
- 如果劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资低于当地最低工资标准的，应按当地最低工资标准计算经济补偿。
- 对于工作年限不满十二个月的员工，其月平均工资应根据实际工作的月数来计算。
- 若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。
二、不同情形下的赔偿计算
经济补偿：
- 依据上述月工资标准计算。
- 采用“N+1”赔偿模式（在特定情况下，如公司违法解除劳动合同等，可能不适用“+1”部分），其中N代表工作年限对应的月数（每满一年为一个月，不满一年但超过六个月按一年算，不满六个月为半个月）。
- 计算公式：经济补偿 = 工作年限 × 月平均工资（或当地最低工资标准/职工月平均工资三倍，视情况而定）
违法解除或终止劳动合同的赔偿金：
- 按经济补偿标准的两倍计算。
- 计算基数同样为劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
- 计算公式：赔偿金 = 2 × 经济补偿
工伤赔偿中的停工留薪期工资：
- 职工因工作受伤或患职业病需暂停工作接受医疗的，停工留薪期内原工资福利待遇不变。
- “原工资福利待遇”包括基本工资、奖金、津贴等全部应得收入，并非仅指底薪。
三、实际操作中的注意事项
- 保留证据：劳动者在面临裁员或解除劳动合同时，应要求公司出具书面文件，如《裁员通知书》《解除劳动合同协议》等，以明确双方权益。
- 了解权益：在协商赔偿事宜时，劳动者应充分了解自己的权益和赔偿标准，坚持底线，确保赔偿金额不低于法定标准。
- 法律途径：若与公司就赔偿金额无法达成一致，劳动者可申请劳动仲裁或提起法律诉讼来维护自己的合法权益。
举例说明：假设某员工在公司工作了3年，劳动合同解除前十二个月的平均工资为8000元（包括底薪、奖金、津贴等所有收入）。若公司合法解除劳动合同，则应支付的经济补偿为3年 × 8000元/年 = 24000元；若公司违法解除劳动合同，则应支付的赔偿金为2 × 24000元 = 48000元。
综上所述，公司赔偿工资的计算是一个综合考量多种因素的过程，劳动者应充分了解相关法律规定和计算标准，以确保自己的合法权益得到有效保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。