规划条件变更不能仅通过政府会议纪要作为协议来确认，这不符合法定程序和要求。以下从多个角度进行分析：

一、规划条件变更的法定程序

规划条件的变更通常涉及城市规划、土地利用等重大公共利益，因此必须遵循严格的法定程序。一般来说，规划条件的变更需要经过规划部门的审批，并可能涉及听证、公示等环节，以确保公众的知情权和参与权。政府会议纪要虽然可以记录会议讨论的内容和决定，但它本身并不具备法律上的强制力和约束力，不能作为规划条件变更的直接依据。

二、协议的法律性质

协议是双方或多方之间就特定事项达成的共识，并具有法律约束力的文件。在规划条件变更的情境中，如果涉及多方利益（如政府、开发商、业主等），那么变更规划条件应当通过正式的协议或合同来确认，并明确各方的权利和义务。政府会议纪要虽然可以反映政府的决策意向，但它并不等同于协议或合同，不能替代正式的法律文件。

三、可能的法律后果

如果仅凭政府会议纪要来变更规划条件，可能会引发一系列法律问题。例如，其他利益相关方可能会对此提出异议，认为变更程序不合法或侵犯了他们的合法权益。此外，如果变更后的规划条件与原有的法律法规或政策相冲突，那么该变更也可能面临被撤销或无效的风险。

四、建议与操作

1. 遵循法定程序：在变更规划条件时，应严格按照相关法律法规和政策的要求进行，确保变更程序的合法性和合规性。
2. 签订正式协议：如果涉及多方利益，应签订正式的协议或合同来确认变更内容，并明确各方的权利和义务。
3. 公示与听证：在变更规划条件前，应进行公示和听证等程序，以确保公众的知情权和参与权。

如果您在规划条件变更方面遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。