违建起诉行政机关确实存在时效限制，这一限制主要依据《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定。以下是对这一问题的详细分析：

1. 起诉期限的基本规定：

   • 根据《中华人民共和国行政诉讼法》第四十六条，公民、法人或者其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。这意味着，如果您认为行政机关对违建的处理行为侵犯了您的合法权益，您需要在知道或应当知道该行为之日起六个月内提起诉讼。

2. 特殊情况下的起诉期限：

   • 如果因不动产提起诉讼的案件自行政行为作出之日起超过二十年，或者其他案件自行政行为作出之日起超过五年提起诉讼的，人民法院将不予受理。这一规定特别适用于涉及不动产（如房屋）的违建案件，如果违建处理行为作出后超过二十年，您将失去通过诉讼途径解决争议的机会。

3. 起诉期限的起算点：

   • 起诉期限的起算点是从您知道或者应当知道行政机关作出违建处理行为之日起计算。这要求您密切关注行政机关的行政行为，并在知道或应当知道后及时采取行动。

4. 超过起诉期限的法律后果：

   • 如果您超过了法定的起诉期限，人民法院将不予受理您的起诉。这意味着您将失去通过法律途径维护自己合法权益的机会，因此务必注意起诉期限的限制。

建议与提醒：

• 如果您认为行政机关对违建的处理行为存在不当或违法之处，建议您在知道或应当知道该行为之日起尽快咨询专业律师，并准备相关证据材料，以便在法定期限内提起诉讼。
• 同时，您也可以考虑通过行政复议等途径解决争议，但同样需要注意相关期限的限制。

总结：违建起诉行政机关确实存在时效限制，您需要在知道或应当知道行政机关作出违建处理行为之日起六个月内提起诉讼，且需注意不动产案件二十年和其他案件五年的最长起诉期限。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。