在贪污案件的调查阶段，如果犯罪嫌疑人自杀，赃款仍然会被追回。以下从不同角度为你详细分析：

法律义务与责任

1. 赃款追缴的法定性：根据我国《刑法》第六十四条的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔。这一规定明确了赃款追缴的法定性，不因犯罪嫌疑人的死亡而免除。因此，即使犯罪嫌疑人在调查阶段自杀，其违法所得的赃款仍然需要被追回。

2. 赃款追缴的独立性：赃款追缴是独立于刑事诉讼程序的一种法律措施。它的主要目的是恢复被犯罪行为破坏的社会经济秩序，保护受害人的合法权益。因此，赃款追缴并不完全依赖于刑事诉讼的进行或犯罪嫌疑人的生死。

实际操作与程序

1. 调查阶段的赃款追缴：在贪污案件的调查阶段，如果侦查机关已经掌握了犯罪嫌疑人违法所得的线索或证据，可以依法对赃款进行查封、扣押或冻结。这些措施旨在防止赃款的流失或转移，为后续的追缴工作打下基础。

2. 犯罪嫌疑人自杀后的处理：如果犯罪嫌疑人在调查阶段自杀，侦查机关会继续推进赃款的追缴工作。这可能包括进一步调查赃款的去向、追查相关涉案人员、查封或扣押与赃款有关的财产等。同时，侦查机关还会与相关部门（如银行、金融机构等）合作，共同追缴赃款。

3. 赃款追缴的完成：一旦赃款被成功追回，侦查机关会依法将其上缴国库或返还给受害人。如果赃款无法追回或部分追回，侦查机关会依法责令犯罪嫌疑人的家属或相关责任人进行退赔。

特殊情况与考虑

1. 赃款已转移或挥霍：如果犯罪嫌疑人在自杀前已经将赃款转移或挥霍殆尽，那么追缴工作可能会面临更大的困难。在这种情况下，侦查机关会尽力追查赃款的去向，并依法采取相应的措施。但需要注意的是，如果赃款确实无法追回，那么受害人可能无法获得全额赔偿。

2. 家属的配合程度：在赃款追缴过程中，犯罪嫌疑人的家属的配合程度也会影响追缴工作的进展。如果家属能够积极配合侦查机关的工作，提供有关赃款的线索或证据，那么追缴工作可能会更加顺利。反之，如果家属不配合或故意隐瞒信息，那么追缴工作可能会受到阻碍。

建议：

• 对于受害者或相关利益方来说，如果面临贪污案件且犯罪嫌疑人自杀的情况，应积极配合侦查机关的工作，提供有关赃款的线索或证据，以便尽快追回赃款。
• 如果对赃款追缴的具体程序或法律规定有疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。