公司请假半天扣工资的计算方式需结合公司规章制度、劳动合同约定以及法律法规综合判断，常见情形如下：

1. 按日工资比例扣除
   若公司规章制度或劳动合同明确规定“请假半天扣除日工资的50%”，且该制度经民主程序制定并公示（或已告知劳动者），则属于合法操作。
   计算逻辑：日工资=月工资÷21.75天（法定月计薪天数），半天工资=日工资×50%。
   法律依据：《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》（劳社部发〔2008〕3号）明确月计薪天数为21.75天，扣除比例需合理且明确。

2. 按实际缺勤时间扣除
   若公司未明确规定扣除比例，但按实际缺勤时间折算工资（如半天按4小时扣除，小时工资=月工资÷21.75÷8），亦符合法律规定。
   关键点：需确保小时工资计算基数不低于当地最低工资标准，且扣除后实发工资不得低于最低工资。

3. 不得扣除的情形

   • 法定带薪假：如年假、婚假、产假等，请假期间工资需全额发放，不得扣除。
     
   • 医疗期病假：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期内公司需支付病假工资（通常为当地最低工资的80%）。
     
   • 公司违法扣除：若制度未公示、未经民主程序，或扣除比例显失公平（如扣除全天工资），劳动者可主张补发工资并要求公司整改。

建议行动：

1. 查阅劳动合同、员工手册中关于请假扣薪的条款；
   
2. 确认公司制度是否经民主程序制定并公示；
   
3. 若发现违法扣除，可先与公司协商，协商不成可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
   

如有具体案例或制度条款需要分析，可进一步提供细节，我会为您详细解答。