如果企业以时效过了进行抗辩，员工可以采取以下措施来应对：
核实时效问题：
- 首先，员工需要明确自己主张权益的具体时效期限。在劳动争议中，不同的权益主张可能有不同的时效规定。例如，根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。但如果是因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年时效期间的限制，不过，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
- 员工应仔细审查自己的情况，确定是否确实超过了时效期限。如果未超过，则企业以时效过了进行抗辩是不成立的。
寻找时效中断或中止的证据：
- 如果员工发现自己的主张可能已经超过了时效期限，不要轻易放弃。根据法律规定，时效期间可能因某些法定事由而中断或中止。例如，员工在时效期间内向企业提出了主张，或者向有关部门请求了权利救济，这些都可能导致时效中断，重新计算时效期间。
- 员工应积极寻找并收集相关证据，如书面主张、邮件、短信、录音等，以证明时效期间的中断或中止。
考虑特殊情况下的时效延长：
- 在某些特殊情况下，法律可能允许时效期间的延长。例如，如果员工因不可抗力或其他正当理由无法在时效期间内提出主张，法律可能会给予一定的宽限期。
- 员工应评估自己的情况是否符合时效延长的条件，并收集相关证据以支持自己的主张。
积极应诉并准备反驳证据：
- 如果企业确实以时效过了进行抗辩，并且员工无法找到时效中断、中止或延长的证据，那么员工仍然需要积极应诉。在应诉过程中，员工可以准备反驳证据，如证明自己一直在主张权利、企业承认债务等，以削弱企业的抗辩理由。
- 同时，员工也可以强调企业抗辩的不合理性或恶意性，争取仲裁员或法官的支持。
寻求法律援助或咨询：
- 如果员工对时效问题或劳动争议处理流程不熟悉，可以寻求法律援助或咨询专业律师。律师可以帮助员工分析案情、提供法律意见，并协助员工准备应诉材料。
- 作为专业律师，我建议员工在处理此类问题时保持冷静和理性，不要因情绪激动而做出不利于自己的决策。
可能面临的法律后果及建议：
- 如果员工的主张确实超过了时效期限，并且无法找到时效中断、中止或延长的证据，那么员工可能会面临败诉的风险。在这种情况下，我建议员工考虑与企业进行协商和解，以争取一定的补偿或权益。
- 如果员工认为企业的抗辩是不合理的或恶意的，员工也可以考虑通过其他途径维护自己的权益，如向劳动监察部门投诉、提起民事诉讼等。但需要注意的是，这些途径可能需要更长的时间和更多的精力投入。
总之，面对企业以时效过了进行抗辩的情况，员工应保持冷静和理性，积极核实时效问题、寻找时效中断或中止的证据、考虑特殊情况下的时效延长、积极应诉并准备反驳证据，并在必要时寻求法律援助或咨询。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。