民办非企业单位的投资人死亡后，其出资份额一般不能直接作为遗产继承，但可以通过特定方式处理相关权益。具体分析如下：

1. 民办非企业单位的法律性质
   根据《民办非企业单位登记管理暂行条例》，民办非企业单位属于非营利性法人，其资产来源包括出资人投入、捐赠、合法积累等。出资人投入的资产在单位存续期间归单位所有，出资人不享有所有权或股权，因此出资份额本身不属于遗产范围。

2. 出资人权益的继承问题

   • 若章程有约定：若民办非企业单位的章程明确规定出资人死亡后其权益的处理方式（如由其他出资人回购、转为捐赠等），则按章程执行。
     
   • 若章程无约定：出资人的继承人不能直接继承出资份额，但可能通过以下途径主张权益：
     
     • 剩余财产分配请求权：若单位解散清算，在清偿债务后，剩余财产可按章程或法律规定分配给原出资人（但需以章程未禁止为前提）。
       
     • 经济利益补偿：若出资人实际参与经营并获得劳动报酬，继承人可继承其未领取的合法收入（如工资、奖金等）。

3. 实务建议

   • 审查章程：优先核查单位章程对出资人权益继承的约定，避免因条款缺失引发纠纷。
     
   • 协商处理：继承人可与其他出资人或单位协商，通过转让、回购等方式实现权益变现。
     
   • 法律程序：若协商无果，可通过诉讼确认权益归属，但需承担举证责任（如证明出资性质、单位盈利情况等）。

总结：民办非企业单位的出资份额因单位性质无法直接继承，但继承人可通过章程约定、剩余财产分配或协商等方式间接实现权益。具体操作需结合单位章程、出资协议及实际经营情况综合判断。如有进一步疑问，可直接向我咨询。