设施农业用地使用结束后复垦的法律依据主要来源于《土地管理法》及相关部门规章和政策文件。以下从不同角度为您详细阐述：
一、法律层面
《土地管理法》：
- 该法第四十三条规定：“因挖损、塌陷、压占等造成土地破坏，用地单位和个人应当按照国家有关规定负责复垦；没有条件复垦或者复垦不符合要求的，应当缴纳土地复垦费，专项用于土地复垦。复垦的土地应当优先用于农业。”这一条款明确规定了用地单位和个人在土地破坏后的复垦责任，以及复垦土地的优先用途。
《土地复垦条例》：
- 虽然《土地复垦条例》主要针对的是生产建设活动损毁的土地，但其中关于复垦的原则、责任、规划、实施和监督等规定，同样适用于设施农业用地使用结束后的复垦工作。特别是该条例强调了“谁损毁，谁复垦”的原则，与《土地管理法》中的规定相呼应。
二、部门规章和政策文件层面
自然资源部（原国土资源部）及相关部门发布的政策文件：
- 自然资源部会同农业农村部等部门，针对设施农业用地的管理，发布了一系列政策文件，如《关于设施农业用地管理有关问题的通知》等。这些文件虽然主要关注的是设施农业用地的审批、使用和管理，但也间接涉及了用地结束后的复垦要求。例如，可能要求用地者在申请用地时提交复垦方案，或在用地合同中明确复垦责任和义务。
地方性法规和政策：
- 各地根据《土地管理法》和《土地复垦条例》等法律法规，结合本地实际情况，制定了地方性法规和政策文件，对设施农业用地使用结束后的复垦工作提出了更具体的要求。这些地方性法规和政策可能包括复垦的标准、程序、验收等环节，以及复垦费用的缴纳和管理等。
三、复垦的具体要求和程序
复垦方案：
- 用地者在申请设施农业用地时，通常需要提交复垦方案，明确复垦的目标、措施、时间表和预算等。复垦方案应经过相关部门的审批或备案，确保复垦工作的可行性和有效性。
复垦实施：
- 用地结束后，用地者应按照复垦方案的要求，及时组织复垦工作。复垦工作应包括土地平整、土壤改良、植被恢复等环节，确保复垦后的土地达到农业利用的标准。
复垦验收：
- 复垦工作完成后，用地者应向相关部门申请复垦验收。验收部门将根据复垦方案和复垦标准，对复垦后的土地进行实地检查和评估。只有通过验收的土地，才能被认定为复垦合格，并优先用于农业。
四、法律后果
如果用地者未按照法律法规的要求进行复垦，或者复垦不符合要求，将可能面临以下法律后果：
缴纳土地复垦费：
- 用地者可能需要缴纳土地复垦费，专项用于土地复垦工作。复垦费的金额和缴纳方式将根据相关法律法规和地方性政策的规定执行。
行政处罚：
- 相关部门有权对未履行复垦义务的用地者进行行政处罚，包括罚款、责令限期改正等。如果用地者拒不改正，还可能面临更严厉的处罚措施。
民事责任：
- 如果用地者的复垦行为给第三方造成了损失，如破坏了相邻土地的生产条件或造成了环境污染等，用地者还可能需要承担民事赔偿责任。
总结与建议：设施农业用地使用结束后的复垦工作是一项重要的法律责任和义务。用地者应严格遵守相关法律法规和政策文件的要求，制定并执行复垦方案，确保复垦工作的质量和效果。如果遇到复垦方面的法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律意见和帮助。