死者儿子完全有权去法院起诉，且不存在诉讼时效过期的问题。以下从几个关键角度为你详细分析：

一、关于起诉主体资格

死者儿子作为死者的直系血亲，在死者去世后，依法享有继承死者遗产的权利。在哥哥试图霸占房产的情况下，死者儿子作为法定继承人之一，当然有权通过法律途径维护自己的合法权益，即向法院提起诉讼，要求确认自己对房产的继承份额或阻止哥哥的不当行为。

二、关于诉讼时效

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，继承权纠纷提起诉讼的期限为三年，自继承人知道或者应当知道其权利被侵犯之日起计算。但这里有一个重要的例外情况：自继承开始之日起超过二十年的，不得再提起诉讼。在你所描述的情况中，虽然死者已经去世三年多，但并未超过二十年的最长诉讼时效期间。因此，死者儿子现在提起诉讼，在诉讼时效上是完全可行的。

三、关于起诉的具体操作

1. 收集证据：死者儿子需要收集能够证明自己对房产享有继承权的证据，如死者的遗嘱（如果有）、亲属关系证明、房产证等。虽然哥哥拿走了主要证件，但死者儿子仍可以通过其他途径获取这些证据的复印件或相关证明，比如向房产管理部门申请查询房产信息、向公安机关申请出具亲属关系证明等。
2. 确定被告：在起诉时，死者儿子需要将哥哥列为被告，明确诉讼请求，如要求确认自己对房产的继承份额、要求哥哥返还拿走的证件等。
3. 选择法院：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，继承纠纷案件由被继承人死亡时住所地或者主要遗产所在地人民法院管辖。因此，死者儿子可以选择向死者死亡时的住所地法院或房产所在地的法院提起诉讼。

四、关于可能面临的法律后果

如果法院经审理认为死者儿子对房产享有继承权，且哥哥的行为构成侵权，那么法院可能会判决哥哥返还拿走的证件、确认死者儿子对房产的继承份额，甚至可能要求哥哥赔偿因侵权行为给死者儿子造成的损失。

五、建议与提醒

在处理此类纠纷时，建议死者儿子保持冷静和理性，通过法律途径解决问题。同时，也可以考虑在起诉前与哥哥进行协商，看是否能够达成和解协议，以节省时间和精力。如果协商无果，再果断选择诉讼途径维护自己的权益。

最后，如果你在处理此类纠纷过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会尽我所能为你提供专业、全面的法律服务。