您好，关于果树用地建设大棚是否需要办理设施农用地手续的问题，这主要取决于大棚的具体类型和建设方式。
首先，我们要明确什么是设施农业用地。设施农业用地是指农业生产中直接用于作物种植和畜禽水产养殖的生产设施用地，以及与农业生产直接关联的附属或配套设施用地。这包括直接用于作物设施种植（如工厂化栽培、育种育苗大棚、连栋温室、日光温室等）的设施用地，以及为生产服务的看护房、检验检疫监测、病虫害防控等辅助设施用地。
对于您提到的果树用地建设大棚，如果大棚是地面不硬化、覆盖透光塑料薄膜的简易棚架，且不破坏耕作层，那么这种农业生产简易大棚（棚架、温室）通常不纳入设施农业用地范围，可以按原地类管理，无需办理设施农业用地手续。
然而，如果大棚内进行了地表耕作层的改变，比如采用了水培模式栽种果树，或者大棚内建设了与农业生产直接相关的附属或配套设施（如烘干晾晒设施、分拣包装场所等），且这些设施符合设施农业用地管理规定，那么就需要办理设施农业用地备案手续。
具体办理流程如下：
签订用地协议：经营主体需要拟订建设方案，并与农村集体经济组织、土地承包经营权人签订设施农业用地协议。协议使用期限不得超过土地承包期限，期满后如需继续使用，需要重新签订用地协议。
申报用地备案：协议签订后，将用地协议与设施农业建设方案等相关材料一并报乡镇政府（街道办事处）备案。
上图入库：由项目所在地县级自然资源主管部门在省级设施农业用地备案监管系统中上图入库。
此外，还需要注意的是，设施农业用地不得占用永久基本农田。如果大棚建设需要占用一般耕地，还需要办理耕地进出平衡手续，确保耕地的数量和质量不减少。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。