您好，关于设施农业用地建设棚圈项目是否需要办理许可证的问题，这主要取决于项目的具体性质、规模以及所在地区的具体规定。以下是我为您提供的详细解答：

首先，根据《国土资源部、农业部关于进一步支持设施农业健康发展的通知》以及相关土地利用分类标准，设施农用地是指直接用于经营性养殖的畜禽舍、工厂化作物栽培或水产养殖的生产设施用地等，这些用地按农用地进行管理，并不属于一般的建设用地。

对于设施农业项目中的棚圈建设，如果其性质属于直接用于农产品生产的设施用地（如畜禽舍），并且符合设施农用地的相关要求和标准，那么这类用地通常不需要按照一般建设项目的流程去办理建设用地规划许可证、建设工程规划许可证等。但是，这并不意味着完全不需要任何手续。

具体来说，设施农业项目通常需要依次办理以下手续：

1. 规划土地意见书：这是项目选址和用地规划的重要依据。不过，对于某些小型或特定类型的设施农业项目（如没有建（构）筑物的场地型项目或用地面积很小的小型项目），可能免于办理此证书。

2. 设施农业用地备案：这是设施农业项目用地管理的重要环节，用于确认项目的用地性质、规模等是否符合规定。

3. 乡村建设规划许可证：对于需要建设建（构）筑物的设施农业项目，通常需要办理此证书。但同样，对于某些小型项目，可能免于办理或简化办理流程。

此外，不同地区可能根据本地实际情况，对设施农业项目的手续办理有进一步的具体要求和优化措施。例如，上海市就发布了相关通知，进一步明确和优化了本市设施农业项目手续办理的相关要求，包括强化市、区协同联动管理机制、明确项目选址规划依据、审批办理要求等。

因此，我建议您：

• 首先确认您的棚圈建设项目是否属于设施农业项目的范畴，并了解其具体的用地性质和规模。
• 接着，咨询您所在地区的规划资源部门或农业农村部门，了解当地对于设施农业项目手续办理的具体要求和流程。
• 根据咨询结果，按照规定的流程和要求办理相关手续，以确保项目的合法性和合规性。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。