根据《土地管理法》第五十八条，因公共利益需要收回国有土地使用权时，对地上建筑物的补偿及收回程序需分情况处理，具体如下：

1. 补偿原则：有偿收回，保障权益

• 法律依据：第五十八条明确规定，收回国有土地使用权时，对土地使用权人应当给予“适当补偿”。这里的“适当补偿”需结合建筑物实际价值、剩余使用年限、市场评估等因素综合确定，而非简单按成本价补偿。
• 补偿范围：包括建筑物本身的价值（如重置成本、折旧）、因收回导致的直接损失（如搬迁费用、停产停业损失）等。若建筑物为合法建设（有产权证或合法审批手续），补偿标准通常参照市场评估价或双方协商结果。

2. 收回程序：分步实施，依法进行

• 第一步：作出收回决定
  由县级以上人民政府自然资源主管部门（原国土部门）拟订收回方案，报同级人民政府批准。收回决定需明确收回范围、用途、补偿方式等，并公告通知土地使用权人。
• 第二步：协商补偿或评估
  与土地使用权人协商补偿金额；协商不成的，可委托专业评估机构对建筑物价值进行评估，作为补偿依据。
• 第三步：签订补偿协议并执行
  双方签订补偿协议后，政府按协议支付补偿款，土地使用权人交付土地及建筑物。若拒不交付，政府可申请法院强制执行。

3. 特殊情形处理

• 建筑物违法建设：若建筑物未取得合法审批手续（如无规划许可、施工许可），可能被认定为违法建筑。此时，政府可依法无偿拆除，但需按《行政强制法》程序进行（如催告、公告、强制执行决定等），且不得扩大拆除范围。
• 历史遗留问题：对因历史原因未办理产权证的合法建筑（如早期单位集资房），需结合地方政策、实际使用情况等综合认定，通常仍会给予一定补偿。

4. 争议解决途径

• 若对补偿标准或收回程序有异议，土地使用权人可：
  1. 申请行政复议：向作出收回决定的政府的上一级机关提出；
  2. 提起行政诉讼：直接向法院起诉，要求撤销收回决定或重新确定补偿金额。

提示：实践中，收回程序可能因地方政策、项目性质（如基础设施建设、旧城改造）等有所差异。若涉及具体案件，建议提供建筑物产权证明、收回决定文件等材料，以便进一步分析补偿合理性及程序合法性。如有疑问，可直接向我咨询细节。