当电动自行车与违章停放的车辆相撞，且双方被认定为同等责任时，关于医药费的支付问题，我们可以依据相关法律法规及事故具体情况来详细解析。
首先，要明确的是，在同等责任的情况下，双方应各自承担50%的赔偿责任。这意味着，对于因事故产生的医疗费用，双方都需要按照这一比例来分担。
关于医疗费用的具体支付：
医疗费用的确定：
- 医疗费用是根据医疗机构出具的医药费、住院费等收款凭证，结合病历和诊断证明等相关证据来确定的。
- 如果赔偿义务人对治疗的必要性和合理性有异议，他们需要承担相应的举证责任。
- 医疗费的赔偿数额，是按照一审法庭辩论终结前实际发生的数额来确定的。对于后续必然发生的费用，如器官功能恢复训练所必要的康复费、适当的整容费等，也可以与已经发生的医疗费一并予以赔偿。
医疗费用的分担：
- 既然双方是同等责任，那么医疗费用也应按照50%的比例进行分担。
- 例如，如果总医疗费用为10000元，那么双方各自应承担5000元。
赔偿流程与注意事项：
协商：
- 事故双方可以首先尝试通过友好协商来解决赔偿问题。
- 在协商过程中，应明确各自的损失情况和赔偿比例，并尽量达成书面协议，以避免后续纠纷。
调解：
- 如果协商不成，可以请求公安机关交通管理部门或相关调解组织进行调解。
- 调解应遵循自愿、合法的原则，并制作调解书作为赔偿的依据。
诉讼：
- 如果调解仍无法达成一致，任何一方都有权向人民法院提起诉讼。
- 在诉讼过程中，法院将根据事实和法律规定作出判决，确定双方应承担的赔偿金额。
注意事项：
- 在处理赔偿问题时，务必保留好相关证据，如医疗记录、费用清单等。这些证据将有助于支持您的赔偿主张。
- 事故发生后，应及时向公安机关交通管理部门报案，以便他们进行调查和责任认定。
- 如果电动自行车或机动车投保了相关保险，应了解保险赔偿的范围和流程，以便在赔偿过程中充分利用保险资源。
综上所述，当电动自行车与违章停放的车辆相撞且双方负同等责任时，医疗费用应按照50%的比例进行分担。双方可以通过协商、调解或诉讼等方式来解决赔偿问题，并务必保留好相关证据和及时了解保险情况。