核心结论：立案标准第五十六条中“造成税款损失五万元”是指因违法行为导致国家税款无法追回的实际损失金额达到五万元，即使后续补缴税款，若违法行为已满足立案时的损失标准，仍可能被立案追责。是否立案需结合违法行为性质、主观故意、补缴时间等因素综合判断，以下分情况说明：

1. “造成税款损失五万元”的认定标准

根据《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）》第五十六条（通常指逃税罪等涉税案件），立案需满足“造成国家税款损失累计数额在五万元以上”。这里的“损失”指：

• 实际无法追回的税款：例如通过虚假申报、隐匿收入等方式逃避缴纳税款，且税务机关无法通过追缴、强制执行等手段收回的金额；
• 时间节点：以立案时已确定的损失金额为准，不因后续补缴而自动消除。若立案前已补缴全部税款，可能不构成“损失”；但若立案时损失已达五万元，即使后续补缴，仍可能被追究刑事责任（但补缴可作为量刑情节从轻处理）。

2. 已补缴税款是否影响立案？需分阶段判断

• 立案前补缴：
  若在税务机关立案侦查前，纳税人主动补缴税款、滞纳金，并接受行政处罚（如罚款），且未造成实际税款损失（即税务机关未因违法行为产生无法追回的损失），则可能不满足立案条件。但需注意：若补缴前损失已达五万元，或存在其他严重情节（如多次逃税、伪造凭证等），仍可能被立案。

• 立案后补缴：
  若立案时已确认税款损失达五万元，即使后续补缴，不影响立案的合法性，但补缴行为可能作为量刑时的从轻情节（如减少罚金、缓刑等）。根据《刑法》第二百零一条，逃税罪的成立需以“经税务机关依法下达追缴通知后，不补缴应纳税款、不缴纳滞纳金或不受行政处罚”为前提，但若损失已达五万元且存在其他严重情节（如数额巨大、手段恶劣），仍可能直接追究刑事责任。

3. 关键风险提示

• 主观故意的影响：若纳税人通过故意隐瞒、伪造账目等手段逃税，即使补缴，仍可能被认定为“恶意逃税”，立案风险更高；
• 补缴的及时性：主动补缴（如自查发现后立即补缴）与被动补缴（如被税务机关查处后补缴）对立案的影响不同，前者可能降低追责概率；
• 行政处罚与刑事追责的衔接：根据《行政执法机关移送涉嫌犯罪案件的规定》，若税务机关已作出行政处罚（如罚款），但损失仍达五万元，仍需移送公安机关立案。

建议：若涉及涉税问题，应尽快委托专业律师评估行为性质、损失金额及补缴情况，制定合规方案以降低风险。如有具体案件细节，可直接向我咨询，我会结合证据材料提供针对性分析。