当合伙纠纷双方在没有进行清算的情况下起诉到法院，法院的判决会基于一系列法律程序和证据收集来进行。以下是一个详细且深入的解答，帮助您理解这一过程：

一、法院判决的基本原则

在合伙纠纷中，若双方未进行清算，法院通常会遵循以下原则进行判决：

1. 合法性原则：法院会确保所有判决均基于合法有效的证据和法律规定。
2. 公平性原则：法院会努力确保判决结果对双方都是公平的，避免偏袒任何一方。
3. 事实为依据原则：法院会依据双方提供的证据和事实情况来作出判决。

二、法院可能采取的步骤

1. 要求双方进行清算：

   • 法院可能会首先要求双方进行清算，以明确合伙期间的财务状况、利润分配和亏损分担等。
   • 若一方不配合清算，法院可能会根据另一方提供的证据和财务资料，结合相关法律规定，进行推算或估算。

2. 审查证据：

   • 法院会仔细审查双方提供的证据，包括合伙协议、出资证明、财务记录、业务往来资料等。
   • 证据的充分性和合法性将是法院判决的重要依据。

3. 听取双方陈述：

   • 法院会给予双方充分的机会来陈述自己的观点和理由。
   • 双方可以就合伙期间的财务状况、利润分配、亏损分担等问题进行辩论。

4. 作出判决：

   • 基于上述步骤，法院会作出判决，明确双方的权利义务关系。
   • 判决可能包括要求一方支付另一方应得的利润或分担的亏损，或者对合伙财产进行分配等。

三、若一方不配合清算的特别处理

若一方不配合清算，法院可能会采取以下特别措施：

1. 推算或估算财务状况：

   • 法院可能会根据另一方提供的证据和财务资料，结合相关法律规定，对合伙期间的财务状况进行推算或估算。
   • 这可能包括利润分配、亏损分担、资产价值等方面的推算。

2. 强制执行：

   • 若判决后一方仍不履行义务，法院可能会采取强制执行措施，如查封、扣押、拍卖财产等。
   • 强制执行旨在确保判决得到有效执行，保护另一方的合法权益。

四、建议与注意事项

1. 收集充分证据：

   • 在起诉前，确保收集到充分、合法的证据来支持自己的诉讼请求。
   • 证据应包括合伙协议、出资证明、财务记录、业务往来资料等。

2. 遵循法律程序：

   • 整个起诉过程需严格遵循法律程序，确保合法合规。
   • 如有需要，可咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。

3. 做好心理准备：

   • 清算过程可能耗时较长，且结果可能不如预期。
   • 双方应做好心理准备，以应对可能出现的各种情况。

综上所述，当合伙纠纷双方在没有进行清算的情况下起诉到法院时，法院会基于合法性、公平性和事实为依据的原则进行判决。若一方不配合清算，法院可能会采取推算或估算财务状况、强制执行等特别措施。因此，在起诉前，双方应收集充分证据、遵循法律程序，并做好心理准备。