关于竞业协议中约定赔偿100万是否合法的问题，结论前置如下：

1. 竞业协议本身合法，但高额赔偿需符合法定条件。竞业限制协议是用人单位与劳动者之间为保护商业秘密和竞争优势而签订的合法协议，但其中约定的赔偿金额需合理，且需满足法定条件。

2. 赔偿金额的合理性需由法院或仲裁机构判定。若赔偿金额过高，劳动者有权请求法院或仲裁机构适当减少，法院会综合考虑实际损失、违约情节、工资水平等因素进行判定。

详细分析如下：

竞业协议的基本概念与法律效力

竞业协议，或称为竞业禁止协议，是用人单位为保护自身商业利益和商业秘密，与特定劳动者（如高级管理人员、技术人员等负有保密义务的人员）约定的一种限制性协议。它旨在限制劳动者在离职后一定期限内从事与原单位有竞争关系的业务或活动。只要竞业协议的内容合法、双方自愿签订，且不违反法律法规的强制性规定，该协议即具有法律效力。

赔偿金额的合理性探讨

1. 法定条件：

   • 竞业协议中约定的赔偿金额需合理，不能显失公平。若赔偿金额过高，可能被视为对劳动者的不公平限制，从而影响协议的效力。
   • 用人单位主张高额违约金时，需证明实际损失。缺乏具体证据支持的高额索赔可能得不到法院全额支持。

2. 法院判定标准：

   • 若劳动者认为赔偿金额过高，可请求法院或仲裁机构适当减少。法院在判定时会综合考虑多种因素，包括但不限于实际损失、违约情节、工资水平、竞业限制期限等。
   • 例如，如果劳动者的月工资仅为1万元，而竞业协议中约定的赔偿金额为100万，这显然超出了合理范围，法院可能会根据实际情况进行调减。

劳动者的应对策略

1. 严格遵守协议：

   • 劳动者应遵守竞业协议，避免违反竞业限制义务，以免承担法律责任。

2. 协商解除：

   • 在特殊情况下，劳动者可与用人单位协商解除协议，并就经济补偿达成一致。这有助于避免不必要的法律纠纷。

3. 依法维权：

   • 若用人单位未履行支付补偿等义务，或赔偿金额显失公平，劳动者可通过法律途径维护权益，包括申请仲裁或提起诉讼。

用人单位的注意事项

1. 合理约定赔偿金额：

   • 用人单位在签订竞业协议时，应合理约定赔偿金额，避免过高或过低。过高的赔偿金额可能得不到法院支持，而过低的赔偿金额则可能无法有效约束劳动者。

2. 按时支付经济补偿：

   • 用人单位应按时足额支付经济补偿，确保协议的有效性。这是劳动者遵守竞业协议的重要前提。

3. 合法追究责任：

   • 若劳动者违反协议，用人单位有权要求支付违约金并继续履行竞业限制义务。同时，需注意收集和保存相关证据，以便在法律程序中证明自己的主张。

总结与建议：

竞业协议中约定赔偿100万是否合法，取决于多种因素，包括赔偿金额的合理性、实际损失的大小、违约情节的严重程度等。建议用人单位在签订竞业协议时，务必合理约定赔偿金额，并按时支付经济补偿；劳动者在签订协议前，应仔细阅读条款，了解自己的权利和义务，并在必要时咨询专业律师。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。