被挂靠公司是否承担劳动仲裁赔偿，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度为你详细分析：
一、劳动关系认定是关键
若劳动者与被挂靠公司存在事实劳动关系：
- 根据《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。若未订立书面劳动合同，但存在事实劳动关系（如劳动者接受被挂靠公司的管理、从事其安排的工作、由其支付工资等），则被挂靠公司作为用人单位，应承担劳动仲裁中的赔偿责任。
- 例子：张某被挂靠在A公司名下从事工作，但实际接受A公司的管理，工资也由A公司支付。若张某在工作中受伤，申请劳动仲裁要求赔偿，A公司作为用人单位，应承担相应的赔偿责任。
若劳动者与被挂靠公司不存在劳动关系：
- 若劳动者实际上是与挂靠人（即实际用工者）建立劳动关系，与被挂靠公司无直接关联，则被挂靠公司通常不承担劳动仲裁中的赔偿责任。但需注意，若被挂靠公司存在过错（如允许挂靠人以其名义招用劳动者、未尽到监管职责等），可能需承担一定的连带责任或补充责任。
- 例子：李某挂靠在B公司名下，但自行招用王某从事工作，工资由李某支付。若王某在工作中受伤，申请劳动仲裁要求赔偿，一般情况下，B公司不承担赔偿责任。但若B公司允许李某以其名义招用劳动者，且未尽到监管职责，导致王某权益受损，B公司可能需承担一定的连带责任。
二、挂靠协议的约定
- 挂靠协议是挂靠人与被挂靠公司之间关于挂靠事宜的约定。若协议中明确约定了劳动仲裁赔偿责任的承担方式，则应按照协议约定执行。但需注意，挂靠协议的约定不得违反法律法规的强制性规定，否则可能无效。
- 例子：C公司与D公司签订挂靠协议，约定若因挂靠事宜引发劳动仲裁，赔偿责任由D公司承担。若后续确实发生劳动仲裁，且赔偿责任属于协议约定的范围，则C公司可依据协议要求D公司承担赔偿责任。
三、法律建议
对于劳动者：
- 在申请劳动仲裁前，应先明确自己的用人单位是谁，即与谁存在劳动关系。可通过收集工作证、工资条、考勤记录等证据来证明。
- 若对劳动关系存在争议，可先向劳动争议仲裁委员会申请确认劳动关系，再申请劳动仲裁要求赔偿。
对于被挂靠公司：
- 应加强对挂靠人的监管，确保其合法用工，避免因挂靠人的违法行为而承担不必要的法律责任。
- 在签订挂靠协议时，应明确约定劳动仲裁赔偿责任的承担方式，以降低法律风险。
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