核心结论：土地承包经营权证上仅登记了已故户主信息时，可通过变更登记或继承程序解决，具体需结合家庭承包关系是否存续、承包地是否由其他家庭成员继续经营等因素判断。以下是具体分析：

一、若家庭承包关系仍存续，其他家庭成员可申请变更登记

根据《农村土地承包法》第十六条及《农村土地承包经营权证管理办法》第十五条，家庭承包的承包方是本集体经济组织的农户，户主死亡后，只要该农户仍有其他家庭成员，承包关系不因户主死亡而终止，其他家庭成员可继续承包。此时：

1. 变更登记条件：需满足“承包方家庭成员情况发生变动”或“承包土地状况发生较大变化”等情形，例如原户主死亡后，其他家庭成员协商确定新的代表人（如配偶、子女等）。
2. 办理流程：
   • 向发包方（村集体经济组织或村委会）提出变更申请，提交原土地承包经营权证、户主死亡证明、家庭成员身份证明及协商确定新代表人的协议等材料；
   • 发包方审核后，报乡（镇）人民政府农村土地承包管理部门；
   • 县级人民政府农村土地承包管理部门审核通过后，办理变更登记并换发新证。

二、若家庭承包关系已终止（如无其他家庭成员），承包地由集体收回，但地上附着物及青苗补偿可继承

若原户主死亡后，该农户无其他家庭成员（如独生子女户且子女已死亡），则承包关系终止，承包地由村集体收回。但根据《民法典》第一千一百二十二条，承包地上的附着物（如树木、房屋）及青苗补偿费属于承包户的合法财产，可由继承人继承。此时：

1. 继承程序：继承人需向村集体说明情况，协商处理地上附着物及青苗补偿费的分配；
2. 注意事项：若承包地已被集体收回并重新发包，继承人无权要求返还承包地，但可主张地上附着物的补偿。

三、若存在争议（如家庭成员对变更登记或继承有分歧），可通过协商、调解或诉讼解决

1. 协商：家庭成员可自行协商确定新代表人或继承方案；
2. 调解：向村集体、乡（镇）人民政府或农村土地承包仲裁委员会申请调解；
3. 诉讼：若协商、调解无果，可向人民法院提起民事诉讼，由法院根据《农村土地承包法》《民法典》等法律规定判决。

建议：您可先确认家庭承包关系是否存续（即是否有其他家庭成员继续承包），再根据情况选择变更登记或继承程序。若涉及争议，建议收集户主死亡证明、家庭成员身份证明、承包地经营情况等证据，以便后续处理。如有进一步疑问，可直接向我咨询。