核心结论：针对您已签两年房屋租赁合同且还有半年到期，备案税费的处理主要取决于备案状态及当地政策，以下是具体分析：

1. 若房屋已备案：

   • 备案税费已缴纳：在租赁合同备案时，通常需要缴纳一定的税费，如房产税、个人所得税（针对出租方）或印花税等（具体税种和税率因地区而异）。若备案时已一次性缴纳了整个租赁期的税费，那么在合同剩余半年内，您无需再额外缴纳税费，除非当地政策有特殊规定或要求按年申报调整。
   • 备案税费未缴纳或分期缴纳：若备案时未一次性缴纳全部税费，而是约定分期缴纳，或当地政策要求按年申报缴纳，那么您需按照备案时的约定或当地政策规定，在剩余租赁期内继续履行缴纳税费的义务。

2. 若房屋未备案：

   • 需尽快补办备案并缴纳税费：根据《商品房屋租赁管理办法》等相关规定，房屋租赁合同应当办理备案登记。若您的房屋租赁合同尚未备案，建议您尽快前往当地房地产管理部门或相关机构补办备案手续，并按照当地政策规定缴纳相应的税费。未备案的租赁合同可能面临一定的法律风险，如被处罚、无法享受相关政策优惠等。
   • 税费计算与缴纳：在补办备案时，您需要根据当地政策规定计算应缴纳的税费，并按照规定的流程和期限进行缴纳。税费的具体计算方式和标准因地区而异，建议您咨询当地房地产管理部门或税务机关以获取准确信息。

3. 注意事项：

   • 了解当地政策：不同地区的房屋租赁备案税费政策可能存在差异，因此您需要了解并遵守当地的具体规定。
   • 保留相关凭证：在缴纳税费时，请务必保留好相关的缴费凭证和备案证明，以备不时之需。
   • 及时沟通协商：若您在备案或缴纳税费过程中遇到任何问题或困难，建议及时与出租方、当地房地产管理部门或税务机关进行沟通协商，寻求解决方案。