事业单位停薪留职期间，一般情况下工龄是应当计算的，但具体是否计算以及如何计算，可能受到多种因素的影响。以下是对此问题的详细分析：

一、停薪留职的基本定义与背景

停薪留职是指职工在特定情况下，经单位批准后，暂时离开工作岗位，保留劳动关系，但不享受工资福利待遇的一种制度。这一制度起源于特定历史时期，旨在解决富余人员问题，同时保障职工的基本权益。在事业单位中，停薪留职也作为一种特殊的人事管理方式存在。

二、停薪留职期间工龄计算的一般原则

1. 劳动关系保留：停薪留职期间，职工与事业单位的劳动关系并未解除，这是工龄计算的基础。因为工龄的计算通常与职工在单位的连续工作时间相关联，而停薪留职并未中断这种连续性。

2. 政策依据：根据国家相关规定，特别是早期关于企业职工停薪留职的通知精神，虽然停薪留职期间职工不享受工资、奖金等福利待遇，但其他待遇（如工龄计算等）通常不变。这一原则在事业单位中同样适用，尽管具体政策可能因地区和单位而异。

三、影响停薪留职期间工龄计算的因素

1. 单位政策与规定：不同的事业单位可能根据自身情况和相关政策，对停薪留职期间的工龄计算有具体的规定。例如，有些单位可能要求职工在停薪留职期间自行缴纳社会保险费用，若未按规定执行，可能影响工龄的计算。

2. 停薪留职的原因与时长：停薪留职的原因（如个人申请、单位安排等）和时长也可能影响工龄的计算。如果停薪留职是由于职工个人原因导致的，且单位已按照相关规定进行处理，那么这段期间可能不被计入工龄。此外，停薪留职的时长也可能成为单位考虑是否计算工龄的因素之一。

3. 社保缴纳情况：在停薪留职期间，职工是否自行缴纳社保费用也是影响工龄计算的一个重要因素。如果职工在停薪留职期间未缴纳社保费用，可能导致社保缴费年限的中断，进而影响工龄的计算和养老金等福利待遇的享受。

四、特殊情况下的工龄计算

1. 自动离职与停薪留职的区别：需要注意的是，自动离职与停薪留职是两种不同的概念。自动离职通常指职工未经单位批准擅自离职的行为，这种情况下工龄一般不予计算。而停薪留职是经单位批准的，且劳动关系保留，因此工龄计算的原则与自动离职不同。

2. 事业单位特殊规定：某些事业单位可能根据自身情况和相关政策，对停薪留职期间的工龄计算有更为具体或特殊的规定。例如，对于因单位原因导致的停薪留职，单位可能更倾向于计算工龄；而对于因职工个人原因导致的停薪留职，单位则可能不予计算工龄。

五、建议与操作

1. 了解单位政策：职工在办理停薪留职前，应详细了解所在事业单位的相关政策规定，特别是关于工龄计算的部分。这有助于职工明确自己的权益和义务，避免后续产生纠纷。

2. 保留相关证据：在停薪留职期间，职工应保留好与单位签订的停薪留职协议、社保缴纳证明等相关证据。这些证据在后续工龄计算或纠纷处理中可能起到关键作用。

3. 及时咨询与沟通：如果职工对停薪留职期间的工龄计算有疑问或需要争取权益，应及时与单位进行沟通并咨询相关部门或专业人士的意见。这有助于职工更好地维护自己的合法权益。

总结来说，事业单位停薪留职期间工龄是否计算，需根据单位政策、停薪留职原因、时长以及社保缴纳情况等多种因素综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。