当公司发生变更，如名称、法定代表人、主要负责人、投资人、经营范围、经营期限、股权结构等变化时，员工合同的处理需严格遵循《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，以确保双方权益得到充分保障。以下是对不同变更情形下员工合同处理方式的详细解答：

一、基本原则

1. 劳动合同的继续有效：根据《劳动合同法》第三十三条，公司变更名称、法定代表人、主要负责人或者投资人等事项，并不影响劳动合同的履行。原劳动合同继续有效，双方应继续按照合同约定履行各自的义务。

2. 协商一致原则：若公司变更导致劳动合同无法履行或需要变更劳动合同内容，公司应与员工协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。

二、具体处理方式

1. 企业名称、法定代表人等变更

   • 这种情况下，公司的法律主体资格并未改变，只是内部信息发生了变化。
   • 公司无需与员工重新签订劳动合同，但应及时以书面形式通知员工变更情况，并更新劳动合同中的相关信息（如企业名称、法定代表人等）。
   • 如果劳动合同中有明确约定以企业名称为合同生效条件，且企业名称变更导致合同无法履行，双方可协商解除合同或签订补充协议。

2. 企业合并、分立等变更

   • 根据《劳动合同法》第三十四条，公司发生合并或者分立等情况，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的公司继续履行。
   • 合并或分立后，公司应及时通知员工，并与员工协商劳动合同的变更事宜，如工作地点、岗位等。
   • 如果双方无法就变更达成一致，公司可依据法律规定解除劳动合同，但需支付经济补偿金。

3. 企业经营场所、经营范围、经营期限等变更

   • 这些变更通常不会直接影响劳动合同的履行，但如果变更导致劳动合同无法履行或需要调整工作内容，公司应与员工协商一致后变更劳动合同。
   • 对于经营场所的变更，特别是跨地区变更，公司需与员工充分沟通，协商一致变更工作地点条款。若员工不同意，公司不能强行要求，若因此解除劳动合同，需支付经济补偿。

4. 企业股权结构等实质性变更

   • 股权结构变更不直接涉及劳动合同的履行，但如果变更导致企业管理层、经营策略等重大变化，可能影响劳动合同的履行。
   • 在此情况下，公司应与员工积极沟通，协商劳动合同的变更或解除事宜，确保员工权益不受损害。

三、注意事项

1. 及时通知员工：无论何种变更，公司都应及时通知员工，确保员工了解变更情况，并做好相应的准备。

2. 保留相关证据：在处理劳动合同变更事宜时，公司应保留好相关证据，如通知记录、协商记录、变更协议等，以备不时之需。

3. 遵守法定程序：在变更或解除劳动合同过程中，公司应严格遵守法定程序，确保合法合规，避免引发劳动争议。

四、特殊情况下的经济补偿

在企业合并、分立或性质变更导致劳动合同主体变更且双方协商一致终止原劳动合同时，员工有权申请经济补偿金。具体标准根据工作年限和工资水平等因素确定，公司应按照法律规定支付。

综上所述，公司变更后员工合同的处理应遵循法律法规的规定，确保双方权益得到充分保障。公司应及时通知员工变更情况，合理调整劳动合同，并保障员工权益。员工也应关注自身权益变化，必要时寻求专业律师帮助维护合法权益。