在合同纠纷中，被告申请法庭调查令查交易流水，一般情况下是会通知原告律师的。以下从几个方面进行详细分析：
一、法庭调查令的基本性质与目的
法庭调查令是法院为了查明案件事实，依法向有关单位或个人调取证据的一种法律文书。在合同纠纷中，如果被告认为需要调取原告的交易流水等证据来支持自己的主张或反驳对方的主张，可以向法院申请法庭调查令。这一制度的目的是确保案件事实的查明，保障当事人的合法权益。
二、通知原告律师的必要性
保障原告的知情权：原告作为合同纠纷的一方，有权知道被告申请调取了哪些证据，以及这些证据可能对自己的权益产生何种影响。通知原告律师，可以确保原告及时了解案件进展，做好应对准备。
维护诉讼程序的公正性：诉讼程序应当公开、公正、公平。通知原告律师，可以确保双方当事人在诉讼过程中享有平等的权利，避免一方利用信息不对称优势损害另一方的利益。
便于原告提出异议：如果原告认为被告申请调取的证据与案件无关或侵犯了自己的隐私等合法权益，可以在收到通知后及时向法院提出异议，请求法院不予调取或限制调取范围。
三、实际操作中的通知方式
在实际操作中，法院在签发法庭调查令后，通常会通过书面形式通知原告律师或原告本人。通知内容会包括调查令的具体内容、调取证据的范围、调取时间等关键信息。原告律师在收到通知后，应当及时与原告沟通，了解原告的意见和诉求，并据此制定相应的诉讼策略。
四、特殊情况下的处理
当然，也存在一些特殊情况，如涉及国家秘密、商业秘密或个人隐私等敏感信息时，法院可能会根据具体情况决定是否通知原告律师或采取其他保密措施。但这种情况相对较少，且法院在决定不通知时，会充分考虑当事人的合法权益和诉讼程序的公正性。
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