关于甲乙双方合作协议中保证金不满的问题，这通常涉及到合作协议的具体条款以及相关法律法规的适用。以下是从不同角度对此问题的分析：

1. 合作协议的具体约定：

   • 首先，需要仔细审查甲乙双方签订的合作协议，特别是关于保证金的条款。合作协议中通常会明确保证金的金额、支付方式、支付时间以及保证金不足时的处理方式等。
   • 如果合作协议中有明确规定保证金不足时的补足方式或违约责任，那么双方应按照协议约定执行。例如，协议可能规定一方需在保证金不足时的一定期限内补足，否则将承担违约责任。

2. 法律法规的适用：

   • 如果合作协议中没有明确规定保证金不足时的处理方式，或者规定不明确，那么可以参考相关法律法规。在合同纠纷中，通常适用的是《中华人民共和国民法典》中关于合同的规定。
   • 根据《民法典》的相关规定，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。如果一方未按照约定支付保证金或保证金不足，可能构成违约，需要承担违约责任。违约责任的具体形式可能包括继续履行、采取补救措施、赔偿损失等。

3. 实际操作建议：

   • 沟通协商：在保证金不足的情况下，建议甲乙双方首先进行沟通协商，尝试达成一致意见。通过友好协商，可以避免不必要的法律纠纷，并维护双方的合作关系。
   • 书面通知：如果一方认为另一方未按照约定支付保证金或保证金不足，且协商无果，可以向对方发出书面通知，要求其在一定期限内补足保证金或承担违约责任。书面通知应明确说明事实、理由和要求，并保留好相关证据。
   • 法律途径：如果双方无法通过协商解决争议，且书面通知也未得到回应或未达到预期效果，那么可以考虑通过法律途径解决。这包括向法院提起诉讼或申请仲裁等。在法律程序中，需要提供充分的证据来支持自己的主张，并遵循法律程序的规定。

4. 可能的风险与后果：

   • 如果一方未按照约定支付保证金或保证金不足，且未采取补救措施或承担违约责任，那么可能面临法律纠纷和声誉损失等风险。
   • 在法律纠纷中，如果法院或仲裁机构认定一方存在违约行为，那么该方可能需要承担赔偿损失、支付违约金等法律责任。这些责任可能对一方的经济状况产生重大影响。

综上所述，对于甲乙双方合作协议中保证金不满的问题，建议首先审查合作协议的具体约定，然后参考相关法律法规进行适用。在实际操作中，应优先考虑沟通协商和书面通知等方式解决争议；如果无法解决，再考虑通过法律途径解决。同时，要注意可能的风险与后果，并采取相应的防范措施。如果有任何具体疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。