当双方证人的口供不一致时，公安机关接下来会采取一系列措施来查明事实真相，具体包括以下步骤：

1. 进一步调查取证：

   • 公安机关会重新审视现有证据，包括物证、书证、视听资料等，以寻找与证人证言相印证或相矛盾的点。
   • 可能会对案发现场进行复勘，寻找遗漏的线索或证据。
   • 调查与案件相关的其他人员，如目击者、相关知情人士等，以获取更多信息。

2. 分别询问证人：

   • 公安机关会分别对双方证人进行详细询问，了解他们提供证言的背景、依据和细节。
   • 通过询问，试图发现证人证言中的矛盾点或不合理之处，并进一步追问以澄清事实。
   • 询问过程中，公安机关会注意观察证人的表情、语气等非言语信息，以辅助判断证言的真实性。

3. 技术鉴定与比对：

   • 如果案件涉及物证或需要技术鉴定的证据，公安机关会委托专业机构进行鉴定，如指纹鉴定、DNA鉴定等。
   • 通过技术鉴定，可以确定某些证据的真实性和关联性，从而帮助判断证人证言的可靠性。
   • 同时，公安机关也会对证人证言进行比对分析，看是否存在相互矛盾或相互印证的情况。

4. 综合分析判断：

   • 在收集到足够证据后，公安机关会进行综合分析判断，以确定案件的事实真相。
   • 分析过程中，会考虑所有证据的证明力、关联性以及证人证言的合理性等因素。
   • 如果证人证言存在重大矛盾或无法合理解释的情况，公安机关可能会倾向于采信其他更可靠的证据。

5. 依法处理案件：

   • 根据查明的事实真相，公安机关会依法对案件进行处理。
   • 如果证人证言不一致导致案件事实无法查清，公安机关可能会根据现有证据作出相应处理，如不予立案、撤销案件或移送审查起诉等。
   • 在处理过程中，公安机关会确保程序的合法性和公正性，保障当事人的合法权益。