结论前置：工伤使用合作医疗报销后，一般不能直接就报销行为本身起诉，但若因此导致无法享受工伤保险待遇等合法权益受损，可以就工伤赔偿问题起诉用人单位或相关责任方。
关于工伤使用合作医疗报销的情况
在工伤发生后，劳动者本应享受工伤保险待遇。工伤保险是为了保障因工作遭受事故伤害或者患职业病的职工获得医疗救治和经济补偿，促进工伤预防和职业康复，分散用人单位的工伤风险而设立的。而合作医疗，通常指的是新型农村合作医疗（新农合）或者城镇居民基本医疗保险等，主要是针对居民基本医疗需求的一种保障制度。
如果劳动者在工伤后使用了合作医疗进行报销，这本身并不直接构成一个可以起诉的独立事由。因为合作医疗报销是基于其自身的保障范围和规定进行的，与工伤保险是两个不同的保障体系。但是，这种行为可能会带来一些后续问题。
可能引发的法律问题及起诉情况
影响工伤保险待遇的享受：
- 根据《工伤保险条例》等相关规定，工伤职工应享受相应的工伤保险待遇，包括医疗费用报销、伤残津贴、一次性伤残补助金等。如果因为使用了合作医疗报销了部分或全部医疗费用，导致工伤保险机构拒绝支付相应的工伤保险待遇，那么劳动者可以就工伤赔偿问题起诉用人单位或相关责任方。
- 举例：假设劳动者因工伤住院花费了5万元医疗费用，原本应由工伤保险全部报销。但劳动者使用了合作医疗报销了3万元，之后工伤保险机构以“已通过其他途径报销”为由拒绝支付剩余的2万元。此时，劳动者可以起诉用人单位，要求其承担这2万元的赔偿责任（如果用人单位未依法缴纳工伤保险的话），或者要求工伤保险机构纠正错误决定（如果用人单位已依法缴纳工伤保险）。
用人单位未依法缴纳工伤保险：
- 如果用人单位未依法为劳动者缴纳工伤保险，那么劳动者在发生工伤后，所有工伤保险待遇应由用人单位承担。此时，如果劳动者使用了合作医疗报销了部分费用，但仍有未报销的部分或因工伤导致的其他损失（如伤残津贴、误工费等），劳动者可以直接起诉用人单位，要求其承担全部赔偿责任。
- 法律依据：根据《工伤保险条例》第六十二条：“依照本条例规定应当参加工伤保险而未参加工伤保险的用人单位职工发生工伤的，由该用人单位按照本条例规定的工伤保险待遇项目和标准支付费用。”
合作医疗报销存在违规行为：
- 如果劳动者在使用合作医疗报销时存在违规行为（如虚构事实、隐瞒真相等），导致合作医疗基金受损，那么合作医疗管理部门可能会追究劳动者的法律责任。但这与工伤赔偿问题本身是两个独立的法律关系，不影响劳动者就工伤赔偿问题起诉用人单位或相关责任方。
建议
- 保留证据：无论是否使用合作医疗报销，劳动者都应保留好所有与工伤相关的证据，如医疗费用发票、诊断证明、工伤认定书等，以便在后续维权时使用。
- 及时咨询：如果劳动者对工伤赔偿问题有疑问或遇到困难，应及时向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。
- 依法维权：在维权过程中，劳动者应依法行事，避免采取过激或违法的行为，以免给自己带来不必要的麻烦和损失。