在交通事故涉及保险赔付的情况下，商业险的赔付确实需要扣除交强险已赔付的部分。以下是对这一问题的详细解释：
一、交强险与商业险的基本区别与赔偿顺序
交强险：
- 性质：强制保险，具有法定性，所有上路车辆必须购买。
- 赔偿顺序：在发生交通事故导致第三方人身伤亡或财产损失时，交强险首先在其责任限额范围内进行赔付。
- 赔偿限额：分为死亡伤残赔偿限额、医疗费用赔偿限额、财产损失赔偿限额，具体限额根据被保险机动车在道路交通事故中的责任来确定。
商业险：
- 性质：自愿购买的，根据车主需求选择不同险种和保额。
- 赔偿顺序：交强险赔付后，对于仍未得到足额赔偿的部分损失，再根据商业险合同的具体条款约定（如商业三者险等）进行赔付。
二、商业险赔付时扣除交强险的原因
- 法律原则：根据保险法的相关规定和保险合同的约定，保险赔付应遵循损失补偿原则，即被保险人不能因保险事故而获得超过其实际损失的赔偿。
- 避免重复赔付：交强险和商业险都是针对交通事故造成的损失进行赔付的。如果商业险不扣除交强险已赔付的部分，那么被保险人可能会获得重复赔付，这违反了保险法的损失补偿原则。
三、理赔流程与注意事项
- 报案：事故发生后，保留事故现场，并立即向投保的保险公司报案。
- 现场处理与定损修理：保险公司会派人进行现场查勘，确定事故责任和损失情况，并根据查勘结果对车辆进行定损和安排修理。
- 提交单证进行索赔：车主需要向保险公司提交相关的索赔单证，如事故认定书、修理发票等。
- 损失理算与赔付：
- 保险公司收到齐备的索赔单证后，会进行理算，并确定最终的赔付金额。
- 在计算商业险的赔付金额时，会明确扣除已经通过交强险获得的赔偿部分。
- 保险公司的财务人员会根据理赔人员理算后的金额，向车主指定的银行账户划拨赔款。
四、特别提醒
- 不同的商业保险险种和具体合同条款可能存在差异，因此车主在购买保险时应仔细阅读保险合同，了解各项条款的具体内容。
- 在申请理赔时，车主应提供完整、真实的索赔单证，并配合保险公司的调查工作。
- 如对保险公司的理赔决定有异议，车主可以通过合法途径维护自己的权益，如申请仲裁或提起诉讼。
总结：在交通事故保险赔付中，商业险的赔付是在交强险赔付之后进行的，且会扣除交强险已经赔付的金额。车主应充分了解交强险和商业险的赔偿顺序、范围及限额，以便在发生事故时能够迅速、有效地进行理赔申请，维护自身的合法权益。