结论：合同只有一份且一方手动修改的情况下，您并非没有办法，关键在于判断修改是否构成对原合同的合法变更，以及您能否提供证据证明原合同内容或修改未经您同意。
一、合同修改的法律性质
合同是双方意思表示一致的产物，一旦成立，对双方均具有法律约束力。若一方未经对方同意擅自修改合同，这种修改通常不具有法律效力，因为它违背了合同成立的基本原则——双方意思表示一致。然而，如果修改后双方均认可并继续履行，或者修改内容不损害国家、集体和第三人利益，且不违反法律、行政法规的强制性规定，那么这种修改可能被视为对原合同的合法变更。
二、您可采取的措施
收集证据：
- 原合同文本：保留好原始合同文本，这是证明合同最初内容的关键证据。
- 修改痕迹：如果可能，收集合同被修改的痕迹，如手写修改的部分、修改前后的对比照片或复印件等。
- 沟通记录：保存与对方就合同修改进行的所有沟通记录，包括邮件、短信、微信聊天记录等，这些记录可能证明您对修改是否知情或同意。
评估修改内容：
- 分析修改内容是否实质性改变了原合同的权利义务关系。如果修改内容轻微，且不影响合同的整体履行，可能不构成重大违约。
- 如果修改内容实质性改变了原合同，且未经您同意，您有权拒绝履行修改后的合同，并要求对方按照原合同履行。
协商或诉讼：
- 协商：尝试与对方进行协商，寻求双方都能接受的解决方案，如恢复原合同内容、对修改部分进行补充约定等。
- 诉讼：如果协商无果，您可以向法院提起诉讼，要求确认修改无效或要求对方按照原合同履行。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明您的主张。
三、可能面临的法律后果
- 如果修改无效：法院可能判决对方按照原合同履行，或者如果原合同已无法履行，可能判决对方承担违约责任，如赔偿损失等。
- 如果修改有效：如果您无法提供充分证据证明修改未经您同意或修改内容违法，法院可能认定修改有效，您需要按照修改后的合同履行。
四、建议
- 增强证据意识：在签订和履行合同过程中，务必保留好所有相关证据，以备不时之需。
- 及时咨询律师：如果您对合同修改有疑问或担忧，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。
总之，合同只有一份且一方手动修改的情况下，您并非束手无策。通过收集证据、评估修改内容、协商或诉讼等方式，您可以有效维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。