即便有合同和工程量证明，官司仍可能输的原因有多种，以下从几个关键角度为你详细分析：

1. 合同条款存在瑕疵或不明确：

   • 条款不完整或模糊：如果合同中的关键条款，如工程范围、质量标准、付款方式、违约责任等，表述不清或存在歧义，双方可能对合同内容产生不同理解。在诉讼中，法院可能根据合同解释原则，作出对你不利的解释。
   • 条款违法或无效：如果合同中的某些条款违反了法律、行政法规的强制性规定，或者存在欺诈、胁迫等情形，这些条款可能被认定为无效。一旦关键条款无效，整个合同的效力可能受到影响，导致你在诉讼中处于不利地位。

2. 工程量证明存在争议或不足：

   • 证明力不足：虽然你提供了工程量证明，但如果对方能够提出相反证据，如现场勘查记录、监理报告等，证明你的工程量证明存在不实之处，法院可能不会采纳你的证据。
   • 工程量与合同不符：如果实际完成的工程量与合同约定的工程量存在显著差异，且你无法证明这种差异是由于对方原因造成的，法院可能不会支持你按照合同约定的工程量主张权利。

3. 诉讼策略或证据组织不当：

   • 证据收集不全面：在诉讼中，证据是关键。如果你未能收集到充分、有效的证据来支持你的主张，或者证据之间存在矛盾，法院可能无法形成对你的有利判断。
   • 诉讼策略失误：诉讼策略的选择对案件结果有重要影响。如果你未能根据案件实际情况制定合适的诉讼策略，如未及时申请财产保全、未在法定期限内提出反诉等，可能导致你在诉讼中处于被动地位。

4. 对方提出有效的抗辩或反诉：

   • 抗辩理由成立：如果对方能够提出有效的抗辩理由，如你未按合同约定履行义务、存在违约行为等，且这些抗辩理由得到法院支持，你的诉讼请求可能被驳回。
   • 反诉请求成立：如果对方在诉讼中提出反诉，且反诉请求得到法院支持，你不仅可能无法获得预期的赔偿，还可能面临承担反诉责任的风险。

5. 法律适用或司法解释的变化：

   • 法律更新：法律是不断发展的，如果在你提起诉讼后，相关法律或司法解释发生了变化，且这种变化对你的案件不利，法院可能根据新的法律或司法解释作出判决。

针对以上情况，我给出以下建议：

• 完善合同条款：在签订合同时，务必确保合同条款完整、明确、合法，避免出现歧义或违法条款。
• 加强证据收集：在合同履行过程中，注意收集并保存相关证据，如工程量证明、付款凭证、沟通记录等，以备不时之需。
• 制定合适的诉讼策略：在提起诉讼前，充分评估案件情况，制定合适的诉讼策略，并在诉讼过程中根据实际情况及时调整。
• 关注法律动态：及时关注相关法律、司法解释的变化，以便在诉讼中能够准确引用法律条款，维护自己的合法权益。

如果你在合同纠纷或建设工程领域遇到法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。