打官司输了并不意味着对方公司就一定不付工程款，具体结果取决于官司的性质、合同条款以及法院的判决。以下从几个不同角度为你详细分析：

1. 合同条款的约定：

   • 如果建设工程合同中明确约定了工程款的支付条件、时间和方式，并且这些条款不违反法律法规的强制性规定，那么双方应当按照合同约定履行。即使一方在官司中输了，也不影响合同条款的效力，对方公司仍需按照合同约定支付工程款。
   • 如果合同中存在关于争议解决后工程款支付的特别约定，比如“无论官司输赢，工程款均需在工程验收合格后支付”，那么对方公司也需遵守这一约定。

2. 官司的性质和判决结果：

   • 如果官司是关于工程质量的争议，而法院判决你方（即施工方）承担工程质量责任，那么对方公司可能根据判决结果要求你方进行修复或赔偿，但这并不直接免除其支付工程款的义务。除非合同中有明确约定，如“工程质量不合格，发包方有权拒付工程款”。
   • 如果官司是关于工程款支付的争议，而法院判决你方败诉，那么对方公司可能根据判决结果拒绝支付或减少支付工程款。但这种情况通常发生在合同存在瑕疵、你方未履行合同义务或存在其他违约行为时。

3. 法律原则和规定：

   • 根据《民法典》等相关法律法规，合同双方应当遵循诚实信用原则，按照约定履行自己的义务。如果一方不履行合同义务或履行合同义务不符合约定，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
   • 在建设工程合同纠纷中，即使一方在官司中输了，也不意味着其就完全丧失了要求对方支付工程款的权利。如果对方公司存在违约行为或合同中有相关约定，你方仍可以通过法律途径主张自己的权益。

4. 实际执行中的可能性：

   • 即使法院判决对方公司支付工程款，如果对方公司无力支付或拒不执行判决，你方可能需要通过申请强制执行等法律手段来维护自己的权益。这可能需要一定的时间和成本，但并不意味着工程款就无法追回。

建议：

• 在签订建设工程合同时，务必明确约定工程款的支付条件、时间和方式，以及争议解决的方式和后果。
• 如果发生纠纷，及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果。
• 在官司过程中，积极收集证据，证明自己的主张，以便在法院判决中争取有利的结果。

如果你有任何关于建设工程合同纠纷的具体问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。