行政协议适用诉讼时效的情形主要包括以下几种：

1. 行政机关不依法履行或未按约定履行行政协议

   • 诉讼时效参照民事法律规范：根据《最高人民法院关于审理行政协议案件若干问题的规定》第二十五条，当行政机关不依法履行或未按照约定履行行政协议时，公民、法人或其他组织提起诉讼的，诉讼时效参照民事法律规范确定。这意味着，在此类纠纷中，诉讼时效一般为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
   • 举例说明：假设某企业与政府签订了一份行政协议，约定政府在一定期限内提供某项服务或支付某笔款项。若政府未按约定履行，企业可以在知道或应当知道权利受损之日起三年内提起诉讼，要求政府履行协议或赔偿损失。

2. 行政机关变更、解除行政协议的行政行为

   • 起诉期限依照行政诉讼法及其司法解释确定：对于行政机关变更、解除行政协议的行政行为，公民、法人或其他组织提起诉讼的，起诉期限依照《行政诉讼法》及其司法解释确定。根据《行政诉讼法》第四十六条，一般起诉期限为六个月，自知道或应当知道作出行政行为之日起计算。
   • 举例说明：若政府单方面变更或解除了与某企业的行政协议，企业不服并提起诉讼的，应在知道或应当知道该行政行为之日起六个月内提出。

3. 涉及不动产的行政协议案件

   • 特殊诉讼时效规定：对于因不动产提起的诉讼，如果自行政行为作出之日起超过二十年，人民法院将不予受理。这一规定体现了对土地及不动产物权稳定性的保护。
   • 举例说明：若一份涉及土地使用权的行政协议因某种原因被提起诉讼，且自行政行为作出之日起已超过二十年，那么人民法院将不再受理该案件。

4. 其他特殊情况下的诉讼时效

   • 不可抗力或其他不属于起诉人自身原因：如因不可抗力或其他不属于起诉人自身原因超过起诉期限的，被耽误的时间不计算在起诉期限内。例如，因人身自由受到限制而不能提起诉讼的情况。
   • 行政协议中明确约定的履行期限或争议解决方式：如果行政协议中明确约定了履行期限或争议解决方式，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么应当按照约定的内容来确定诉讼时效或起诉期限。

法律建议：

• 在处理行政协议案件时，准确判断诉讼时效期间至关重要。首先需区分是一般行政诉讼还是涉及行政协议的特殊诉讼；其次，根据具体情况选择适用的法律依据，是六个月的起诉期限还是三年的民事诉讼时效；最后，还需考虑是否有特殊规定或特殊情况影响诉讼时效的计算。
• 如果对行政协议的诉讼时效有疑问或遇到相关纠纷，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。

可能产生的法律后果：

• 如果超过诉讼时效期间提起诉讼，人民法院可能不予受理或驳回诉讼请求，导致当事人失去通过法律途径维护自己权益的机会。
• 因此，在涉及行政协议纠纷时，务必注意诉讼时效的计算和把握，及时行使自己的诉讼权利。