在起诉纠纷过程中，如果对方已经还了钱，这确实是一个积极的变化，意味着您的诉讼目的可能已经部分或全部达成。针对这种情况，以下是我为您提供的详细处理建议：

一、确认还款情况

首先，您需要核实对方确实已经偿还了欠款。这包括确认还款的金额是否准确、支付方式是否符合您的要求，以及还款是否已经到账等。如果有任何疑问或不确定的地方，建议您立即与对方沟通，明确还款的具体细节，以确保您的权益得到充分保障。

二、法律选择：撤诉或继续诉讼

在确认对方已经还款后，您需要根据实际情况选择撤诉或继续诉讼：

1. 撤诉：

   • 如果对方已经完全偿还了欠款，并且您对此没有异议，那么您可以考虑向法院提交书面撤诉申请。
   • 在撤诉申请中，您需要说明因为对方已经履行了还款义务，双方之间的纠纷已经得到解决，因此申请撤回对被告的起诉。
   • 法院在审查您的撤诉申请后，如果没有违反法律规定等不允许撤诉的情形，通常会裁定准许撤诉。
   • 撤诉后，诉讼程序将终结，您不能就同一事实和理由再次起诉（除非有特殊情况，如新发现的证据等）。
   • 关于诉讼费用，通常由原告减半负担，但具体费用分担方式也可以由双方另行约定。

2. 继续诉讼：

   • 如果您认为对方的还款只是部分解决了问题，或者存在其他争议点需要法院进行裁决，那么您可以选择继续诉讼。
   • 在这种情况下，您可以向法院提交变更诉讼请求的申请，例如要求对方承担诉讼费、律师费等其他合理费用。
   • 诉讼程序将继续进行，围绕新的诉讼请求展开举证、质证等环节，法院将依法作出判决。

三、与法院沟通

无论您选择撤诉还是继续诉讼，都需要及时与承办法官进行沟通。按照法院的要求提交相应的材料或办理相关手续，以确保诉讼程序的顺利进行。

四、保留证据

即使对方已经还款，您也应该妥善保管所有与案件相关的证据材料。这些证据不仅可以在未来可能出现的纠纷中作为支持，也有助于您更好地了解整个案件的情况。例如，借款合同、转账记录、聊天记录等都是非常重要的证据。

五、考虑后续关系

在对方还款后，您还需要评估是否愿意继续与对方保持业务或个人关系。这次还款的经历可能会对双方未来的合作或交往产生影响，因此您需要谨慎考虑。如果您认为对方是一个值得信赖的合作伙伴或朋友，那么可以考虑继续保持关系；如果您对对方的行为仍然存在疑虑或不满，那么可以选择保持距离或终止关系。

综上所述，当对方在起诉过程中履行了还款义务时，您应该根据实际情况灵活选择撤诉或继续诉讼，并确保所有操作均符合法律程序。同时，保留好相关证据并审慎考虑后续关系，以确保自身权益得到充分保护。